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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003105`

染色体: Chr07 坐标: 32877731-32878789 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003105`
名称	SmilChr07G003105
描述	probable calcium-binding protein CML25
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	32877731 - 32878789 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996063`
GeneID	`130996063`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996063`
原始查询	`SmilChr07G003105`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable calcium-binding protein CML25
产物	probable calcium-binding protein CML25
Arabidopsis	`AT1G24620` (AT1G24620) EF hand calcium-binding protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839076] identity=58.5; qcov=0.8; evalue=3.76e-58; confidence=high
Rice	`Os01g0949500` (OsCML10) - identity=49.7; qcov=0.942; evalue=2.82e-52; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF13202 (EF-hand_5); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996063

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057777555.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777555.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057777555.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777555.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777555.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:32878173`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C69
`Chr7:32878173`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C69
`Chr7:32878259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777555.1

190 aa

190

EF-hand_7

EF-hand_1

EF-hand_6

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_7

EF-hand_5

EF-hand_1

EF-hand_6

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_5

PF13499 EF-hand_7 42-104 aa PF00036 EF-hand_1 44-72 aa PF13405 EF-hand_6 44-73 aa PF13202 EF-hand_5 45-69 aa PF13833 EF-hand_8 57-104 aa PF00036 EF-hand_1 80-104 aa PF13202 EF-hand_5 83-103 aa PF13833 EF-hand_8 116-143 aa PF13499 EF-hand_7 117-179 aa PF13202 EF-hand_5 118-141 aa PF00036 EF-hand_1 118-145 aa PF13405 EF-hand_6 118-146 aa PF13833 EF-hand_8 130-178 aa PF00036 EF-hand_1 153-180 aa PF13202 EF-hand_5 161-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	42	104	2.1e-32	112.0	EF-hand domain pair
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	44	72	2.2e-34	115.1	EF hand domain
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	44	73	8.3e-29	97.2	EF-hand domain
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	45	69	4.1e-28	96.2	EF hand
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	57	104	1.8e-21	76.4	EF-hand domain pair
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	80	104	2.2e-34	115.1	EF hand domain
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	83	103	4.1e-28	96.2	EF hand
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	116	143	1.8e-21	76.4	EF-hand domain pair
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	117	179	2.1e-32	112.0	EF-hand domain pair
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	118	141	4.1e-28	96.2	EF hand
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	118	145	2.2e-34	115.1	EF hand domain
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	118	146	8.3e-29	97.2	EF-hand domain
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	130	178	1.8e-21	76.4	EF-hand domain pair
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	153	180	2.2e-34	115.1	EF hand domain
`XP_057777555.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	161	178	4.1e-28	96.2	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921572.1
GAGAGGTAATGATAAATTAGGCGTTTTTTGGTATATCGAAACAGATTTATAGAATGAGACGAATACGCATCCGATTCAACTAATAGCCGGTTTTTAATCCCAACAGAAAGCAAGATCCTATTAAACAGATTTAATCCCAACAGAAAGCAAGATCCTAAACAAAAATAGGCTTAGTATCGTGCCACCACGTACACGTACCCCCCAAAACATTGACACCACCAATCTCCCTCTTCAATAATCTTCTTCTTCTTCACCTTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996063
ATGGGATTCAGATCTCTGTTCAAGAAGAAGAAGCAGCTCCCGATCCCGATCGAATCCACCGTGGCCGCACAGAGCTTCATGATGGCCTCCCGCACGCCGTCGCACAACGGGCGCGCCCGGATAGAGGAGGAGCTGGAGCAGGTCTTCAAGAAGTTCGACGCCAACGGCGACGGCCGGATCTGCGCGGAGGAGCTCGGCTCCATCATGCGCAGCCTCGGCCACCCCGTGACGGAGGACGAGGTGCGCAGCATGATCCGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777555.1
MGFRSLFKKKKQLPIPIESTVAAQSFMMASRTPSHNGRARIEEELEQVFKKFDANGDGRICAEELGSIMRSLGHPVTEDEVRSMIREVDADGDGFIDLREFIELNTSNVDHDEVLDNLRHAFEVFDADKNGAISAEELLNVLRSLGEECTLDDCKKMISGVDIDGSGTIDFDEFKAMMMKGVRFDLAKAD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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