当前解析结果
SmilChr07G003121| 统一基因 ID | SmilChr07G003121 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003121 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003121 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 33120140 - 33122000 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994111 |
|---|---|
| GeneID | 130994111 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130994111 |
| 原始查询 | SmilChr07G003121 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=weak |
| 产物 | MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=weak |
| 拟南芥 | AT3G05850 (MUG7)MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=22.67; qcov=0.951; evalue=7.94e-19; confidence=weak |
| 水稻 | Os02g0192200- identity=25.0; qcov=0.462; evalue=4.19e-14; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994111 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775130.1 |
| 2 | 染色体 | 0.20000 | XP_057775130.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:33120383 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B3,C85 |
Chr7:33120653 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B134,C81 |
Chr7:33120693 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C13,C66 |
Chr7:33120712 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B15,C66 |
Chr7:33120718 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,B67,C66 |
Chr7:33120721 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C23,C84 |
Chr7:33120724 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
Chr7:33120738 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr7:33120740 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B15 |
Chr7:33120741 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B86,C75 |
Chr7:33120752 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B123 |
Chr7:33120759 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B16 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。