当前解析结果
SmilChr07G003124| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003124 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003124 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003124 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 33155425 - 33156318 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994112 |
|---|---|
| GeneID | 130994112 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994112 |
| 原始查询 | SmilChr07G003124 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994112 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775131.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057775131.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057775131.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775131.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775131.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:33155432 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,C40,C51 |
Chr7:33155442 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C67 |
Chr7:33155454 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 15 | B16,B49,B56,B58,B69,B74,B95,C19,C38,C4,C41,C43,C60,C72,D1 |
Chr7:33155462 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B43,B8 |
Chr7:33155478 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | A21,B101,B35 |
Chr7:33155478 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B101,B35 |
Chr7:33155523 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B16,C25 |
Chr7:33155523 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B16,C25 |
Chr7:33155538 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 77 | A13,A2,A21,A23,A3,A4,A5,A8,B1,B104,B105,B106,B109,B112,B122,B127,B132,B138,B28,B29,B30,B32,B33,B35,B36,B49,B53,B55,B56,B59,B62,B64,B65,B67,B69,B76,B83,B86,B90,B92,B93,B96,B97,C12,C13,C16,C17,C18,C25,C28,C29,C30,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C43,C48,C49,C5,C53,C57,C58,C60,C63,C67,C71,C78,C79,C80,C84,D1,D6,D9 |
Chr7:33155576 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C40 |
Chr7:33155605 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A10,B49,C40,C43 |
Chr7:33155683 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B33,B36,B97 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。