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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003127`

染色体: Chr07 坐标: 33185471-33187782 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003127`
名称	SmilChr07G003127
描述	uncharacterized SmilChr07G003127
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33185471 - 33187782 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994114`
GeneID	`130994114`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994114`
原始查询	`SmilChr07G003127`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669]; symbol=MUG3; hit=AT1G06740; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669]; symbol=MUG3; hit=AT1G06740; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=24.2; qcov=0.58; evalue=1.5e-14; confidence=weak
Rice	`Os12g0621300` - identity=25.5; qcov=0.438; evalue=5.28e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994114

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775132.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775132.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775132.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775132.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775132.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33185488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C61
`Chr7:33185495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr7:33185497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C61
`Chr7:33185532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr7:33185537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B32
`Chr7:33185542`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B19,B32,B96,C39,C5
`Chr7:33185542`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B19,B32,B96,C39,C5
`Chr7:33185545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C34,C61
`Chr7:33185556`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B44,C69
`Chr7:33185556`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B44,C69
`Chr7:33185575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr7:33185604`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B12,B14,B48,B80,C69,C74,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775132.1

448 aa

224

448

DBD_Tnp_Mut

PF03108 DBD_Tnp_Mut 262-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775132.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	262	322	7.4e-06	26.2	MuDR family transposase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919149.1
ATGTTTGGTTATTTTGACTTAGAGGAGGAAATCAAGCAGCTTGGGTATACTTCTTGGAGGTGTTTAGCTTTCAAGGTTCCTAGAACTTTAGTGTTTATGGATTTGTGTGATGATAAGCAGGTAATGCAAATGATACAATGTTGTACATCTACAATTACATGTGTGAGTATCTATGTGGATGATGGGAAAAAGGGAAAGGTCAAGAAGGCTGTCACTGAATCTGAAACTGTTACTAAGACAGTTACGAAGACTATAACAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994114
ATGTTTGGTTATTTTGACTTAGAGGAGGAAATCAAGCAGCTTGGGTATACTTCTTGGAGGTGTTTAGCTTTCAAGGTTCCTAGAACTTTAGTGTTTATGGATTTGTGTGATGATAAGCAGGTAATGCAAATGATACAATGTTGTACATCTACAATTACATGTGTGAGTATCTATGTGGATGATGGGAAAAAGGGAAAGGTCAAGAAGGCTGTCACTGAATCTGAAACTGTTACTAAGACAGTTACGAAGACTATAACAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775132.1
MFGYFDLEEEIKQLGYTSWRCLAFKVPRTLVFMDLCDDKQVMQMIQCCTSTITCVSIYVDDGKKGKVKKAVTESETVTKTVTKTITTTKSSSNKGKGKVNQSKGKEKVFDREEPASVVKEQNVQIELSKGKDTDRVVKEQNVHIEPRTEHDVLMEELHETDEDDDDYVPQFSETEDVESDDSLGDKELGSEDEEYMQARSNVRESIGVIAEISLEKENEEERLSEYDDSDKERSDSSDSDGQVVRSKQPKAVYDPRGDIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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