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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003129`

染色体: Chr07 坐标: 33202640-33208096 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003129`
名称	SmilChr07G003129
描述	ankyrin repeat-containing protein At2g01680-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33202640 - 33208096 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996076`
GeneID	`130996076`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996076`
原始查询	`SmilChr07G003129`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat-containing protein At2g01680-like
产物	ankyrin repeat-containing protein At2g01680-like
Arabidopsis	`AT2G01680` (AT2G01680) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814697] identity=66.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0735700` - identity=61.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0008157 (protein phosphatase 1 binding); GO:0019888 (protein phosphatase regulator activity); GO:0035304 (GO:0035304)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF12796 (Ank_2); PF13962 (PGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996076

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777575.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777575.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777575.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777575.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777575.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33207154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777575.1

521 aa

260

521

Ank_2

Ank

Ank_2

Ank

PGG

PF12796 Ank_2 16-104 aa PF12796 Ank_2 81-141 aa PF12796 Ank_2 87-173 aa PF12796 Ank_2 146-208 aa PF00023 Ank 150-174 aa PF12796 Ank_2 181-248 aa PF00023 Ank 186-216 aa PF00023 Ank 219-251 aa PF13962 PGG 334-443 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777575.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	16	104	1.9e-47	160.4	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057777575.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	81	141	1.9e-47	160.4	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057777575.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	87	173	1.9e-47	160.4	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057777575.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	146	208	1.9e-47	160.4	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057777575.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	150	174	1.4e-30	104.3	Ankyrin repeat
`XP_057777575.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	181	248	1.9e-47	160.4	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057777575.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	186	216	1.4e-30	104.3	Ankyrin repeat
`XP_057777575.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	219	251	1.4e-30	104.3	Ankyrin repeat
`XP_057777575.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	334	443	4.6e-26	91.6	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921592.1
TAACTTTGCATAAAGGAGAGGAAAAGAAAAAATATTTTTAGAAAGAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGAGCCACTAAGATTGCAGTTTGCCCACATGATCAATCACTACAACTCATAGCCGAGTATCTGATGCTCTTCTTTTTTCACCGGCGACTCTTTTTCTCTCACTTCTACAAACATCCACTCCTTCTCTCTCTACCATCTCCTTCACACACAGTGGGGAGCATTTTCAACGCGACTTCATCATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996076
ATGGACTCCAAGTCCCTGCGATTCATAACCCACCAATCATTCTTCTCCGCCGTCCGATGCAATGATCTCGAATCGCTCAAGAACCTCATCCAAAATGATGGGTCTGATCCATCTTCGTTGATGGCCCTTCAAAACGACGAGAATGAAACTGCCCTGTACATAGCCGCAGAGAATAATTTCCTCGAGACCTTCGTCTACTTGCTCAGTTTCTGCGATTTGGAGACCGTTAAGATAAGGGCGAAGTCGGATATGAATGCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777575.1
MDSKSLRFITHQSFFSAVRCNDLESLKNLIQNDGSDPSSLMALQNDENETALYIAAENNFLETFVYLLSFCDLETVKIRAKSDMNAFHVAAAKGHLGIVKEFLSHWPELCRVCNSSNTSPLYTAATQNHLDVVNAILDADVSTIRIVRKNGKTALHTTARYGQLSIVKALIERDPGIISIKDKKCQTALHMAAKGQNTAVIEELLEGDISVLNERDKKGSTAVHIATRKSRSQIVTLLLVYRSIDVNAINNDRETAMDIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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