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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003130`

染色体: Chr07 坐标: 33208466-33217846 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003130`
名称	SmilChr07G003130
描述	protein VAC14 homolog
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33208466 - 33217846 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996070`
GeneID	`130996070`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996070`
原始查询	`SmilChr07G003130`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein VAC14 homolog
产物	protein VAC14 homolog
Arabidopsis	`AT2G01690` (AT2G01690) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814698] identity=75.8; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0223700` - identity=76.5; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006661 (phosphatidylinositol biosynthetic process); GO:0010008 (endosome membrane); GO:0033674 (positive regulation of kinase activity); GO:0070772 (PAS complex)
KEGG	-
Pfam	PF02985 (HEAT); PF11916 (Vac14_Fig4_bd); PF12755 (Vac14_Fab1_bd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996070

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777567.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777567.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057777567.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057777567.1`
5	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.40000	`XP_057777567.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33208933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B133,B16,B31,C25
`Chr7:33211545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B131,C1,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777567.1

724 aa

362

724

Vac14_Fab1_bd

HEAT

Vac14_Fig4_bd

PF12755 Vac14_Fab1_bd 65-161 aa PF02985 HEAT 92-121 aa PF11916 Vac14_Fig4_bd 429-608 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777567.1`	Pfam	`PF12755`	Vac14_Fab1_bd	Repeat	65	161	4.2e-49	165.9	Vacuolar 14 Fab1-binding region
`XP_057777567.1`	Pfam	`PF02985`	HEAT	Repeat	92	121	6.2e-18	63.9	HEAT repeat
`XP_057777567.1`	Pfam	`PF11916`	Vac14_Fig4_bd	Domain	429	608	2.2e-70	236.6	Vacuolar protein 14 C-terminal Fig4p binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921584.1
GTTTCAGTAATTTCCGCATTCAGACCAATCCCATGAGCTGTCCGAAGTCGAAGACACACAAACCCCTTCGTCAATTCCACGATGCTGTCCAAAAGAGTACTAAAACAAAACAAAAGAACCCTAATTCGAAAAAACCGAAATTAGTAAAGAAATTGGAAAAGAGTTTCTCCCAAAAATTTCAACTCTATCAGCGTTCTCCTCCCTCTTGCAGATTTCCCCCCCTAATTTTGCGTACTCCGTGACTAGATCTGCTCTCGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996070
ATGGCGGATGCACTATCTGTGGTTCCAGCAGCTGTTCTCCGTAATCTCTCCGATAAGCTCTACGAGAAGCGGAAGAATGCTGCTCTTGAGGTGGAAGGGATAGTGAAACAATTAGCGATGGCTGGTGATCACGATAAGATCACTGCAGTGATCAATTTGCTCACCAATGAATATACCTACTCGCCCCAGGCAAATCATCGTAAAGGAGGTTTGATAGGATTGGCAGCAGCAACAGTGGGTTTGACTTCAGAAGCTGCACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777567.1
MADALSVVPAAVLRNLSDKLYEKRKNAALEVEGIVKQLAMAGDHDKITAVINLLTNEYTYSPQANHRKGGLIGLAAATVGLTSEAAQHLDQIVPPVLNSFADQDSRVRYYACEALYNIAKVVRGDFIVFFNQIFDALCKLSADSDANVQSAAHLLDRLVKDIVTESDQFSIEEFIPLLRERMNVLNPYVRQFLVGWITVLDSVPDIDMLGFLPDFLDGLFNMLSDSSHEIRQQADSALSEFLQEIKNSPSVDYGRMAEIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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