当前解析结果
SmilChr07G003138| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003138 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003138 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003138 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 33269941 - 33271474 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130996093 |
|---|---|
| GeneID | 130996093 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996093 |
| 原始查询 | SmilChr07G003138 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | OspPLAIItheta; symbol=OspPLAIItheta; hit=Os11g0614400; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | OspPLAIItheta; symbol=OspPLAIItheta; hit=Os11g0614400; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT4G37050 (PLP4)PATATIN-like protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829859] identity=52.1; qcov=0.477; evalue=6.14e-24; confidence=medium |
| Rice | Os11g0614400 (OspPLAIItheta)- identity=49; qcov=0.508; evalue=3.11e-25; confidence=medium |
| GO | GO:0004620 (glycerophospholipase activity); GO:0047372 (monoacylglycerol lipase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996093 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057777603.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057777603.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057777603.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777603.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777603.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:33271220 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。