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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003140`

染色体: Chr07 坐标: 33277185-33279533 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003140`
名称	SmilChr07G003140
描述	patatin-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33277185 - 33279533 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996080`
GeneID	`130996080`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996080`
原始查询	`SmilChr07G003140`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	patatin-like protein 2
产物	patatin-like protein 2
Arabidopsis	`AT2G26560` (PLA2A) phospholipase A 2A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817197] identity=56.6; qcov=0.89; evalue=1.97e-162; confidence=high
Rice	`Os08g0477100` (OspPLAIIepsilon) - identity=53.3; qcov=0.868; evalue=7.61e-153; confidence=high
GO	GO:0004620 (glycerophospholipase activity); GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0047372 (monoacylglycerol lipase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01734 (Patatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996080

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777580.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777580.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777580.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777580.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777580.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33277605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B136,B46
`Chr7:33277690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C56,C63
`Chr7:33277912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr7:33278600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr7:33278611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B47,C52
`Chr7:33279293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B7,D3
`Chr7:33279349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777580.1

456 aa

228

456

Patatin

PF01734 Patatin 23-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777580.1`	Pfam	`PF01734`	Patatin	Domain	23	228	3.6e-23	83.5	Patatin-like phospholipase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921597.1
CATTCCTCATGTGGCCCTATTGATTAGTAATATATATGTACGCCCCACCTAACCCTTTTACGCCATTTTTGTGTACATCAACAATCACCCCATACACTTGTACATAATAGAGCTAGCTCCATCACTTTACTAAACTACATTAACTCTCTCTCTAATTAGCATTTGTGTTTGTGAAATCAAAATCAATTAATGGAGGAAATCCCATGCTTCCGTCAGACCGATCAGCCCCCGGATTTCAAGCGGTACATCACCGTTCTTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996080
ATGGAGGAAATCCCATGCTTCCGTCAGACCGATCAGCCCCCGGATTTCAAGCGGTACATCACCGTTCTTAGCATTGACGGCGGCGGAATCAAAGGGATTCTCCCCGCCGTCATCCTCGATTTCCTCGAATCGCAACTACAGGAGTTGGATGGAGAGCAAGCAAGAATCGCCGACTACTTCGACGTGATAGCCGGAACGAGCACCGGCGGCCTCGTCACGGCCATGCTCACAGCTCCCAGCCAAATCAACCGCCCCCTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777580.1
MEEIPCFRQTDQPPDFKRYITVLSIDGGGIKGILPAVILDFLESQLQELDGEQARIADYFDVIAGTSTGGLVTAMLTAPSQINRPLYSGKGIKPFYLENCPKIFPQTHSIFPFGRLLKSLMGPLYDGKHLHSVLKEELQNIKLSQAITDVIIPAFDIKRMQPVIFSTYEAKRNPLLDANFADICISTSAAPTFLPGHEFTTTDAHGNFTEYNLIDGGVAANNPTLIAITEVIRQMFDSGVDYFRMRPVDYPRLLTISIGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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