当前解析结果
SmilChr07G003143| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003143 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003143 |
| 描述 | defensin J1-2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 33323194 - 33324096 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130996100 |
|---|---|
| GeneID | 130996100 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996100 |
| 原始查询 | SmilChr07G003143 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | defensin J1-2-like |
| 产物 | defensin J1-2-like |
| Arabidopsis | AT2G02130 (LCR68)low-molecular-weight cysteine-rich 68 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814744] identity=59.7; qcov=1.04; evalue=2.85e-26; confidence=medium |
| Rice | Os03g0130300 (DEFL8)- identity=75; qcov=0.703; evalue=1.31e-23; confidence=medium |
| GO | GO:0006952 (defense response) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00304 (Gamma-thionin) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996100 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057777611.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057777611.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777611.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777611.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057777611.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777611.1PF00304
Gamma-thionin 28-74 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777611.1 |
Pfam | PF00304 |
Gamma-thionin | Domain | 28 | 74 | 1.7e-18 | 67.3 | Gamma-thionin family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。