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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003146`

染色体: Chr07 坐标: 33367342-33369404 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003146`
名称	SmilChr07G003146
描述	uncharacterized SmilChr07G003146
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33367342 - 33369404 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996087`
GeneID	`130996087`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996087`
原始查询	`SmilChr07G003146`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669]; symbol=MUG3; hit=AT1G06740; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669]; symbol=MUG3; hit=AT1G06740; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=24.2; qcov=0.881; evalue=7.99e-16; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=23.7; qcov=0.658; evalue=5.79e-13; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996087

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777597.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777597.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777597.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777597.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777597.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33367889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B81,D10
`Chr7:33368078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr7:33368234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:33368389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:33368405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B53,C19,C78
`Chr7:33368430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B132,B25,C63,C75
`Chr7:33368496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:33368501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B84,C75
`Chr7:33368501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C75
`Chr7:33368503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr7:33368607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr7:33368615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777597.1

295 aa

148

295

DBD_Tnp_Mut

PF03108 DBD_Tnp_Mut 108-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777597.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	108	170	4.5e-06	26.9	MuDR family transposase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921614.1
TGTCCACTTAGGCGCAAGTAGATTGTACTCAGGTGGTGACGTTTTGGGGAAATTCGGTTTAGATAAGGATATGTTTGGTTATTTTGACTTAGAGGAGGAAATCAAGCAGCTTGGGTATACTTCTTGGAGGTGTTTAGCTTTCAAGGTTCCTAGAACTTTAGTGTTTATGGATTTGTGTGATGATAAGCAGGTAATGCAAATGATACAATGTTGTACATCTACAATTACATGTGTGAGTATCTATGTGGATGATGGGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996087
ATGGAGGAGCTGCATGAAACAGATGAAGATGATGATGATTATGTTCCTCAATTTAGTGAGACAGAGGACGTAGAGTCAGATGATTCTTTAGGTGATAAAGAGCTAGGGTCAGAAGATGAAGAGTATATGCAAGCAAGAAGCAATGTCAGGGAAAGTATTGGTGTCATTGCTGAAATAAGTTTAGAGAAAGAGAATGAAGAAGAAAGATTGTCTGAATATGATGATTCTGACAAAGAGAGGTCTGATAGCAGTGACTCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777597.1
MEELHETDEDDDDYVPQFSETEDVESDDSLGDKELGSEDEEYMQARSNVRESIGVIAEISLEKENEEERLSEYDDSDKERSDSSDSDGQVVRSKQPKAVYDPRGDIADLKLVLGMRFEDGFQCKKALVSWSIVKGHPIHFRRVTKDQCEAYCEEPCQWRIYASIKKNEKSLVVKILGKDHTCAFAIGNKQASYKWLGEEYTEVFRVRPQMCVEDFRNDVKRRFNIVVPNGRLYRAKAHALQLLRGTVQGHYHKLRSYVAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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