当前解析结果
SmilChr07G003155| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003155 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003155 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003155 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 33472798 - 33474766 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994118 |
|---|---|
| GeneID | 130994118 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994118 |
| 原始查询 | SmilChr07G003155 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=36.2; qcov=0.511; evalue=6.82e-36; confidence=medium |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994118 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775137.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057775137.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775137.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775137.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057775137.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:33472820 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B127,C27,C34,C63,C67 |
Chr7:33472943 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A6,C82 |
Chr7:33472951 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C3,C70 |
Chr7:33472954 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B119,B17,C38 |
Chr7:33472958 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 12 | A20,B108,B114,B126,B27,B62,B91,B98,C37,C48,C54,C59 |
Chr7:33473078 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr7:33473098 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B22,B68,C17,C58,C61 |
Chr7:33473172 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B77,B79 |
Chr7:33473175 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B80 |
Chr7:33473183 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B80 |
Chr7:33473213 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C2 |
Chr7:33473218 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。