当前解析结果
SmilChr07G003160| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003160 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003160 |
| 描述 | microtubule-associated protein 70-2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 33519622 - 33525960 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130996072 |
|---|---|
| GeneID | 130996072 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996072 |
| 原始查询 | SmilChr07G003160 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | microtubule-associated protein 70-2-like |
| 产物 | microtubule-associated protein 70-2-like |
| Arabidopsis | AT1G24764 (MAP70-2)microtubule-associated proteins 70-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839083] identity=76; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os02g0736100 (MAP70.2)- identity=77.2; qcov=0.941; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0007010 (cytoskeleton organization); GO:0008017 (microtubule binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07058 (MAP70) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996072 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 1.00000 | XP_057777569.1 |
| 2 | Phragmoplast | Phragmoplast | 0.60000 | XP_057777569.1 |
| 3 | Spindle | Spindle | 0.60000 | XP_057777569.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057777569.1 |
| 5 | Centrosome | 中心体 | 0.40000 | XP_057777569.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:33520010 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B131,C1,C2 |
Chr7:33522317 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B111 |
Chr7:33522839 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B78,D7 |
Chr7:33522905 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B111 |
Chr7:33523163 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C51 |
Chr7:33523433 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A11 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777569.1PF07058
MAP70 59-609 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777569.1 |
Pfam | PF07058 |
MAP70 | Family | 59 | 609 | 1.8e-296 | 985.0 | Microtubule-associated protein 70 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。