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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003165`

染色体: Chr07 坐标: 33675585-33678260 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003165`
名称	SmilChr07G003165
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33675585 - 33678260 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994123`
GeneID	`130994123`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994123`
原始查询	`SmilChr07G003165`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=32; qcov=0.802; evalue=2.55e-92; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=28.4; qcov=0.767; evalue=7.86e-75; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0004803 (transposase activity); GO:0006313 (DNA transposition); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994123

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775141.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775141.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775141.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775141.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33675824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:33675826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:33675836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B139,B32,C4
`Chr7:33675836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B32,C4
`Chr7:33675837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B93,C58,C62,C8,C80,D2
`Chr7:33675938`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A4,A8,A9,B11,B48,C26,C35,C42
`Chr7:33676032`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B47,B53,B63,C20,C61
`Chr7:33676032`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B47,B53,B63,C20,C61
`Chr7:33676043`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A20,B35
`Chr7:33676043`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A20,B35
`Chr7:33676074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C43
`Chr7:33676078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775141.1

739 aa

370

739

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 50-144 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 236-346 aa PF10551 MULE 266-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775141.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	50	144	4.2e-17	63.4	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057775141.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	236	346	3.2e-11	44.0	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057775141.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	266	356	3.5e-25	88.9	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919158.1
ATGTCTGAATCCATGTCGGCTTCAGATGTTATTGAAGAATCTGCAACAGATGTAGTTGGAGAGTCTGCCAATGTATGGTTTCCTGAATGTGATGACAGTAAGAAGCCCTTCGTTGGTCAGATATTCAATGATCTAGTTAAAGCCGTTAAGTTTTACCGTAAGTATGCAAAAGCTTGTGGTTTTGTATCGCGTAAGAGTACAAAAAGTGTCTCTAACGATGGAACTATTCGCATACAATATATGTTGTGCAATAGAGAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994123
ATGTCTGAATCCATGTCGGCTTCAGATGTTATTGAAGAATCTGCAACAGATGTAGTTGGAGAGTCTGCCAATGTATGGTTTCCTGAATGTGATGACAGTAAGAAGCCCTTCGTTGGTCAGATATTCAATGATCTAGTTAAAGCCGTTAAGTTTTACCGTAAGTATGCAAAAGCTTGTGGTTTTGTATCGCGTAAGAGTACAAAAAGTGTCTCTAACGATGGAACTATTCGCATACAATATATGTTGTGCAATAGAGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775141.1
MSESMSASDVIEESATDVVGESANVWFPECDDSKKPFVGQIFNDLVKAVKFYRKYAKACGFVSRKSTKSVSNDGTIRIQYMLCNREGAAPNADELLLADDYFPKKKRKRSSCKVGCEAKIIFQIMSYGRYYVRIFVEGHNHKMVSAGTRHLLPSNRNIEPIHQYFMHAGIKANFGPMRTFRMYVELVGGFDKAGCTSIDFKNYVRDLNVHIVDSDAHMLLDTLKNKKEDCEGFQYFYDVDDENQLSRLIWTDQQSVNNYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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