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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003166`

染色体: Chr07 坐标: 33679665-33680754 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003166`
名称	SmilChr07G003166
描述	uncharacterized SmilChr07G003166
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33679665 - 33680754 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996090`
GeneID	`130996090`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996090`
原始查询	`SmilChr07G003166`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996090

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777600.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057777600.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777600.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777600.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777600.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33679688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:33679690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:33679700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B63,C20,C61
`Chr7:33679703`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B52,B85,C11,C65,C68,C69,C82,C84,C85,D7
`Chr7:33679709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B10,C62
`Chr7:33679770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr7:33679793`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A3,B104,B19,B47,B71,B80,C16,C81
`Chr7:33679819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:33679839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B126,B134,B68
`Chr7:33679841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr7:33679869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B11,B48,C35,C42
`Chr7:33679878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B71,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777600.1

210 aa

105

210

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 41-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777600.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	41	149	0.00011	22.8	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921617.1
TCGATCTACAACATCACCTACTCGTTTCTTTGCCATAATGGACATATATGGCGATTGTATAGAGCCAACAGATTGGTCATACGTTGACCAGAAGCGTGCATTCTTCATGTCATTATACGCAGAATTGTCAGAGTACCATGGCGCTCCACTTTCCGTTATAGACCTTTTTTTCTTCCCGGTTTTCGAGGATGGAAGATACTATGCTTTGTGCTTTGATACACGTCGTAAGCGCCTCTATATACTAGATAGCACTATTGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996090
ATGGACATATATGGCGATTGTATAGAGCCAACAGATTGGTCATACGTTGACCAGAAGCGTGCATTCTTCATGTCATTATACGCAGAATTGTCAGAGTACCATGGCGCTCCACTTTCCGTTATAGACCTTTTTTTCTTCCCGGTTTTCGAGGATGGAAGATACTATGCTTTGTGCTTTGATACACGTCGTAAGCGCCTCTATATACTAGATAGCACTATTGACATCACCGAAAACCAGCTAGAATCGAGATATACTAATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777600.1
MDIYGDCIEPTDWSYVDQKRAFFMSLYAELSEYHGAPLSVIDLFFFPVFEDGRYYALCFDTRRKRLYILDSTIDITENQLESRYTNVCQDVRQLFADYLYYNNEERKANAVANSVEQVVKIKWADRGNTIESGVYLMRHLETFMGDGTQAWKCDVSSKRPQQFTRMRIRYCASILTWESNEVSDVANKASDNFKEMCEDPDFNVNQMLLG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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