当前解析结果
SmilChr07G003167| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003167 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003167 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003167 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 33680717 - 33683546 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994124 |
|---|---|
| GeneID | 130994124 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994124 |
| 原始查询 | SmilChr07G003167 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994124 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775143.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057775143.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057775143.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775143.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775143.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:33680779 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C57 |
Chr7:33680829 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,B101 |
Chr7:33680837 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
Chr7:33680881 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 23 | A13,A14,A24,B103,B128,B138,B17,B42,B43,B46,B50,B81,B89,B97,C13,C16,C31,C49,C54,C55,C57,C73,D3 |
Chr7:33680890 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr7:33680902 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B34,C27,C41,C61 |
Chr7:33680910 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B34,C27,C41,C61 |
Chr7:33681109 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 49 | A10,A16,A2,A21,A24,A25,A8,B107,B114,B117,B119,B125,B13,B134,B138,B139,B14,B17,B25,B28,B32,B42,B43,B53,B58,B65,B71,B76,B90,B97,B98,C12,C13,C18,C23,C29,C38,C46,C52,C53,C57,C58,C6,C7,C76,C82,C87,D10,D4 |
Chr7:33681137 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B23,B34,C45,C71,C82 |
Chr7:33681150 |
GTC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 49 | A11,A19,A22,A23,A3,B103,B104,B108,B109,B127,B130,B132,B18,B2,B31,B32,B35,B36,B37,B40,B48,B5,B50,B54,B58,B59,B6,B66,B67,B82,B83,B84,B88,B9,B94,C16,C19,C20,C36,C49,C63,C64,C70,C85,C86,D11,D2,D3,D5 |
Chr7:33681169 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | A10,B106,B22,B5,B78,B79,C82 |
Chr7:33681337 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B104,B131,C1,C2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。