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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003170`

染色体: Chr07 坐标: 33693047-33695102 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003170`
名称	SmilChr07G003170
描述	uncharacterized SmilChr07G003170
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33693047 - 33695102 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994125`
GeneID	`130994125`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994125`
原始查询	`SmilChr07G003170`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0152500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0152500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0152500` - identity=23.5; qcov=0.754; evalue=1.95e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994125

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775144.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057775144.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775144.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775144.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775144.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33693067`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A10,B124,B128,B136,B23,B81,B89,B98,C29,C48,C53,C87
`Chr7:33693084`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C67,D3
`Chr7:33693084`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C67,D3
`Chr7:33693090`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A5,A8,B104,B109,B113,B131,B134,B138,B40,B55,B59,B62,B76,C1,C2,C29,C5,C9,D1,D8
`Chr7:33693091`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A14,C5,C67,D9
`Chr7:33693091`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A14,C5,C67,D9
`Chr7:33693231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B53,C20,C61
`Chr7:33693321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr7:33693363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,C76
`Chr7:33693365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C27,C38,C45
`Chr7:33693367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr7:33693384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B134,B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775144.1

305 aa

152

305

DUF8566

PF29561 DUF8566 78-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775144.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	78	279	2e-50	172.1	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919161.1
ATGACTGGCAAGGGTAAGAAGGTACAGCGCTCGGATGTTGAGACACCGTTGTCCCCACCATCCAAAAATAAAAGGAGAAAAACTTCTGCTACAGCCGATGCTGGTGGACCATCATCATCACCCTCAACAAGTAAAGTGAAAAAGACTTATGCTAAAGTTGTGACATGCAAACGTCGAGGAGAGAAACAACTTCAGGAAACTGAACCTCCTCCAAAGTTCCCATCTCTAAATACACGCACCACCCCAGCATCGTTCCATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994125
ATGACTGGCAAGGGTAAGAAGGTACAGCGCTCGGATGTTGAGACACCGTTGTCCCCACCATCCAAAAATAAAAGGAGAAAAACTTCTGCTACAGCCGATGCTGGTGGACCATCATCATCACCCTCAACAAGTAAAGTGAAAAAGACTTATGCTAAAGTTGTGACATGCAAACGTCGAGGAGAGAAACAACTTCAGGAAACTGAACCTCCTCCAAAGTTCCCATCTCTAAATACACGCACCACCCCAGCATCGTTCCATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775144.1
MTGKGKKVQRSDVETPLSPPSKNKRRKTSATADAGGPSSSPSTSKVKKTYAKVVTCKRRGEKQLQETEPPPKFPSLNTRTTPASFHDSLRKLNDAQKQAVIDIGFGSILNLKVKKLPARLAFWILENFDERSCELELAGGIKVQITEDDVYRVYGFPKGSEIIPNFERTSNNAMCLEWSLFFGFASREKIKIGAVLSEMLNCSTGGSWFKRHFMIAMAHSLIESCTSGTVHPYILRCLENVTTLRNWNWGEYVLRSLIDH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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