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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003176`

染色体: Chr07 坐标: 33814003-33819576 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003176`
名称	SmilChr07G003176
描述	two-component response regulator ORR21-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33814003 - 33819576 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996071`
GeneID	`130996071`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996071`
原始查询	`SmilChr07G003176`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-component response regulator ORR21-like
产物	two-component response regulator ORR21-like
Arabidopsis	`AT3G16857` (RR1) response regulator 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820940] identity=55.8; qcov=0.519; evalue=4.08e-111; confidence=medium
Rice	`Os03g0224200` (ORR1) - identity=57.8; qcov=0.682; evalue=2.05e-157; confidence=high
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00072 (Response_reg); PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996071

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777568.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777568.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777568.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777568.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777568.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33814589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B119,C27,C31,C41
`Chr7:33815989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:33816371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:33816492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:33818029`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	142	A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A25,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B103,B104,B108,B109,B11,B111,B113,B114,B115,B118,B119,B122,B123,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B137,B138,B140,B15,B17,B18,B19,B20,B21,B23,B24,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B34,B38,B4,B40,B42,B43,B44,B46,B51,B53,B54,B55,B56,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B67,B69,B7,B70,B71,B73,B77,B78,B8,B80,B81,B83,B88,B89,B9,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C27,C28,C29,C3,C31,C33,C37,C38,C40,C42,C45,C49,C50,C53,C54,C56,C63,C64,C65,C66,C67,C70,C73,C77,C78,C8,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D4,D6,D7,D8
`Chr7:33818031`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	142	A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A25,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B103,B104,B108,B109,B11,B111,B113,B114,B115,B118,B119,B122,B123,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B137,B138,B140,B15,B17,B18,B19,B20,B21,B23,B24,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B34,B38,B4,B40,B42,B43,B44,B46,B51,B53,B54,B55,B56,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B67,B69,B7,B70,B71,B73,B77,B78,B8,B80,B81,B83,B88,B89,B9,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C27,C28,C29,C3,C31,C33,C35,C37,C38,C40,C42,C45,C49,C50,C53,C54,C56,C63,C64,C65,C66,C67,C70,C77,C78,C8,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D4,D6,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777568.1

632 aa

316

632

Response_reg

Myb_DNA-binding

PF00072 Response_reg 24-132 aa PF00249 Myb_DNA-binding 211-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777568.1`	Pfam	`PF00072`	Response_reg	Domain	24	132	5.2e-23	82.0	Response regulator receiver domain
`XP_057777568.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	211	260	7.3e-08	33.1	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921585.1
TTATTTTAGCTCGTCTGTCAGCAAACATTCTTTTTCCATATTTATATGCATCAAAGTCTTAAATTTCATATAATTATGATTATGATTATGGGTTGCATTGCAATAATGATGAATGACGGCAGACACAGATACGTACAAAGATTGTATAGAATTGGTAGCAAATACGAACAGCTTTAATGCAGTTTCCTTCACTGTCTTCCGCGTTATCCTTTTTCATATTTAAATCTTTCCTACTCAAATCCACCAATAATCTCTCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996071
ATGGCGTGCGCGAGCGGTGGAAAATTGGAGGTCGCTGCGGCGTCGCAGCAGTTCCCAGTGGGGCTGAGGGTTTTAGTGGTGGATGATGACGTCATCTGCCTGCGTGTTGTGGAGCAAATGCTTCGGAAGTGCATGTATAATGTTACCAGTTGTTCGCAAGCTACAGTTGCTTTGAACTTATTGCGGGAAAGGAAAGGCTCTTTTGATATAGTACTGAGTGATGTTCACATGCCTGATATGGATGGCTTCAAACTTCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777568.1
MACASGGKLEVAAASQQFPVGLRVLVVDDDVICLRVVEQMLRKCMYNVTSCSQATVALNLLRERKGSFDIVLSDVHMPDMDGFKLLELVGLEMGLPVIMMSADGRTNLVMRGVRHGACDYLIKPIRDEELKNIWQHVVRKKQNEMKEHDHSCSMEDHDRLKRAIDDTEYASSLNEGAGADEVLKTLKKRRDSKDEDDEMENDDPTMSKKARVVWSVELHQQFVTAVNQLGIDKAVPKRILELMNVPGLTRENVASHLQKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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