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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003178`

染色体: Chr07 坐标: 33847389-33849607 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003178`
名称	SmilChr07G003178
描述	uncharacterized SmilChr07G003178
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33847389 - 33849607 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996079`
GeneID	`130996079`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996079`
原始查询	`SmilChr07G003178`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=27.4; qcov=1.01; evalue=5.42e-53; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=30.2; qcov=1; evalue=7.82e-61; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996079

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777578.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777578.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777578.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777578.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777578.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33847644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr7:33847655`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C64,D7
`Chr7:33847655`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C64,D7
`Chr7:33847657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,D7
`Chr7:33847659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B26,B30,C31,C4
`Chr7:33847683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B69,C19,C78
`Chr7:33847691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B73,B76,C39,C7
`Chr7:33847692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B2,B90,B92,C39
`Chr7:33847699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B131,C27
`Chr7:33847730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C64,D7
`Chr7:33847748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr7:33847772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777578.1

471 aa

236

471

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 87-180 aa PF00872 Transposase_mut 104-255 aa PF04434 SWIM 323-361 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777578.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	87	180	1.6e-18	67.5	MULE transposase domain
`XP_057777578.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	104	255	2.5e-10	40.5	Transposase, Mutator family
`XP_057777578.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	323	361	4.2e-06	26.9	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921595.1
GCTGAGGCAAAAGTTGGACGCTCAGATCAGGGACGCCTCTATTACAAGTGCAAGCACTCTGATAAGTGCAAGTTTGATGTGCGTGCATCTTGTCACGGTGGAGGGATGTGAGGAGTGCATAAGTTTAAAGAGCACTCTTGCCAAGGGGAATTGGGCATTTTGAAACGAATAAAGGTACACTCGAATGTGGTTGCAGCTTATGTGGAAAAAAGAATACGCGATGATGGAGAGGTCATTAAGCCGAAATCTATTATGGCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996079
ATGGCGGAGTTGTTACGTGAATTTGGAGTCAGAATCAAATATGATGTCGCGCTGCGTGCAAGAAATCTCAGCTTATTAGAGAAGATATACGGTCGAATTGATGATTCGTTCCTTCTTCTGCCAAAATATTTGTATGCCCTAAGGCAAGCGAATCCAGGCACCTTGACGGGTTTGGAAGTAGACGAAAACAACCGGTTCAAACATCTGTTTGTTGCTCTTGCGGCTTCCACCTCACCTTTCTTCTTTTCTCTTCGACCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777578.1
MAELLREFGVRIKYDVALRARNLSLLEKIYGRIDDSFLLLPKYLYALRQANPGTLTGLEVDENNRFKHLFVALAASTSPFFFSLRPVIVLDGTHLKGKNNGILFIAVTKDGNEQVFSLAFGVGPIENDESWKWFLSHVRQTFGQPDNLLVVSDAHVSIANAVKSELPNATHGLCYYHLQNKIKGYGQAVVELFRQAAYTYEDSEFSRAMSAMAQLKPAAYGKLMRVGPEKWARSQCPVTRYSFLTSNAAEALNARLLWAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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