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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003184`

染色体: Chr07 坐标: 33927118-33929285 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003184`
名称	SmilChr07G003184
描述	uncharacterized SmilChr07G003184
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33927118 - 33929285 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994128`
GeneID	`130994128`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994128`
原始查询	`SmilChr07G003184`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=34.9; qcov=1.06; evalue=1.07e-137; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994128

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775147.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057775147.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057775147.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775147.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775147.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33927301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr7:33927384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr7:33927396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A25
`Chr7:33927396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr7:33927403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,B98
`Chr7:33927478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	49	A19,A2,A20,A21,A24,A4,B101,B112,B123,B125,B128,B138,B15,B19,B20,B21,B25,B26,B27,B29,B33,B53,B67,B71,B77,B81,B94,C11,C13,C27,C35,C37,C40,C45,C49,C50,C51,C53,C54,C60,C67,C69,C78,C80,C84,C86,C87,D10,D11
`Chr7:33927501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B95
`Chr7:33927510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B95
`Chr7:33927520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B43,C50
`Chr7:33927580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C4
`Chr7:33927774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:33927778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775147.1

672 aa

336

672

Transposase_21

DUF4218

PF02992 Transposase_21 216-428 aa PF13960 DUF4218 566-671 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775147.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	216	428	2.6e-79	266.1	Transposase family tnp2
`XP_057775147.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	566	671	1.6e-39	135.0	Domain of unknown function (DUF4218)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919164.1
ATGCACGGTGAAGCATTAGTGCAAGTCCCTGATGTTGCTAGGCGATTTGTAACCAATGAACAAGATACAGAAGTAAATCGTTATGAGACGATGGTAATGGATGTAGCAACTGCTCAATTTCACAATGTTGATGATTTAATTGAAGAAACTCCAAACCCAGCAGCCCAACATTTATATGATATGTTAAAGGCGAGTGATAGAGAGTTGTGGCCTGGCTGTAAAACTCATACCCAACTATCTCTTGTAGCTCGATTGATGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994128
ATGCACGGTGAAGCATTAGTGCAAGTCCCTGATGTTGCTAGGCGATTTGTAACCAATGAACAAGATACAGAAGTAAATCGTTATGAGACGATGGTAATGGATGTAGCAACTGCTCAATTTCACAATGTTGATGATTTAATTGAAGAAACTCCAAACCCAGCAGCCCAACATTTATATGATATGTTAAAGGCGAGTGATAGAGAGTTGTGGCCTGGCTGTAAAACTCATACCCAACTATCTCTTGTAGCTCGATTGATGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775147.1
MHGEALVQVPDVARRFVTNEQDTEVNRYETMVMDVATAQFHNVDDLIEETPNPAAQHLYDMLKASDRELWPGCKTHTQLSLVARLMSLKFENNMSERCFDQILELIKEVVPEDNLVTGDFYSAKKLLRGMGLPVERIDCCRNNCMLFWGDDDDLHECKFCDAKRYKESSGASGSRQRRLVAVSQMHYFPITPRLQRLYASKATAADMRWHATSVNDGVMRHPADSPAWKHFDQTFPDFTVEVRNVRLGLCTDGFAPFNSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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