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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003191`

染色体: Chr07 坐标: 34052078-34053373 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003191`
名称	SmilChr07G003191
描述	uncharacterized SmilChr07G003191
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34052078 - 34053373 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994131`
GeneID	`130994131`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994131`
原始查询	`SmilChr07G003191`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0278500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0278500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0278500` - identity=22.7; qcov=0.276; evalue=8.83e-07; confidence=weak
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994131

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057775149.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775149.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057775149.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057775149.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775149.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34052418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr7:34052461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr7:34052496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr7:34052517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A10,A18,A5,B106,B126,B2,B47,B60,B66,B71,B72,B8,C42,C5,C62,C78
`Chr7:34052612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr7:34052616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr7:34052645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C68
`Chr7:34052651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C68
`Chr7:34052654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C68
`Chr7:34052671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B4,B54,B76,C68
`Chr7:34052774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr7:34052965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B33,C46,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775149.1

431 aa

216

431

RRM_1

PF00076 RRM_1 56-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775149.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	56	121	3.9e-06	27.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919166.1
ATGGAGCCTAGAGTGAGCGAGAGAGAGTGGAGAGTGGTGAGAAGAAGAGGGATTGGTCCAAAACATGTCGAGAGAAAACAGGCAAGAAGCTGGAATCGGAGCAGTTTGAATGGGAGGAGAGATTGGAGTTCGAATGAACGTGATGACACTACAACCTTTTTCTTTAACAACATCCCAGAGGATTGCAGCCTTGATTTTCTCAGACGTAAGTTCGAGACGGTTGCGAAGACGGTGGATGTATACTGCCCAAGGAAGAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994131
ATGGAGCCTAGAGTGAGCGAGAGAGAGTGGAGAGTGGTGAGAAGAAGAGGGATTGGTCCAAAACATGTCGAGAGAAAACAGGCAAGAAGCTGGAATCGGAGCAGTTTGAATGGGAGGAGAGATTGGAGTTCGAATGAACGTGATGACACTACAACCTTTTTCTTTAACAACATCCCAGAGGATTGCAGCCTTGATTTTCTCAGACGTAAGTTCGAGACGGTTGCGAAGACGGTGGATGTATACTGCCCAAGGAAGAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775149.1
MEPRVSEREWRVVRRRGIGPKHVERKQARSWNRSSLNGRRDWSSNERDDTTTFFFNNIPEDCSLDFLRRKFETVAKTVDVYCPRKRDLWGRPFGFVRFEKVERSETLLMDLNKLWIGSYKVRVYKPKFQRDYKPKFERVDEKRRNEQNSVKEKKLEQIQPCTMKVYNRHAGVSFKEALTGAKDDKELDDETLQFQTTEEDLVWLNGAFTGYIKSEFLWEEVRDEINSECAGCFKLNSLGGNMVLIQSSNEQTTEENLNKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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