当前解析结果
SmilChr07G003231| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003231 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003231 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003231 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 34302185 - 34310027 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130996137 |
|---|---|
| GeneID | 130996137 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996137 |
| 原始查询 | SmilChr07G003231 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | NADH-ubiquinone oxidoreductase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843056]; symbol=AT1G67350; hit=AT1G67350; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | NADH-ubiquinone oxidoreductase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843056]; symbol=AT1G67350; hit=AT1G67350; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G67350 (AT1G67350)NADH-ubiquinone oxidoreductase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843056] identity=76.5; qcov=0.659; evalue=9.92e-44; confidence=medium |
| Rice | Os03g0685900- identity=59.8; qcov=0.674; evalue=6.45e-37; confidence=medium |
| GO | GO:0005747 (GO:0005747) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF17250 (NDUFB11) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996137 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.80000 | XP_057777632.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057777632.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057777632.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777632.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777632.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777632.1PF17250
NDUFB11 42-126 aa
XP_057777633.1PF17250
NDUFB11 42-126 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777632.1 |
Pfam | PF17250 |
NDUFB11 | Family | 42 | 126 | 5.4e-46 | 155.9 | NADH-ubiquinone oxidoreductase 11 kDa subunit |
XP_057777633.1 |
Pfam | PF17250 |
NDUFB11 | Family | 42 | 126 | 5.4e-46 | 155.9 | NADH-ubiquinone oxidoreductase 11 kDa subunit |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。