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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003269`

染色体: Chr07 坐标: 34441622-34444297 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003269`
名称	SmilChr07G003269
描述	uncharacterized SmilChr07G003269
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34441622 - 34444297 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994147`
GeneID	`130994147`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994147`
原始查询	`SmilChr07G003269`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G23160` (CRK8) cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415] identity=41.9; qcov=0.328; evalue=6.73e-16; confidence=low
Rice	`Os11g0656500` - identity=57.3; qcov=0.322; evalue=1.54e-27; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994147

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775160.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775160.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057775160.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775160.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775160.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34441905`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A2,A21,B123,B19,B20,B67,B99,C6,C78,C8,D11
`Chr7:34441910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr7:34442030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	65	A18,A20,A24,A25,A5,A7,A8,B103,B108,B109,B111,B113,B114,B127,B132,B133,B134,B138,B140,B16,B18,B23,B35,B36,B40,B56,B58,B59,B61,B62,B69,B74,B75,B76,B78,B9,B95,B96,C13,C16,C18,C19,C27,C29,C31,C33,C35,C37,C38,C4,C41,C45,C51,C54,C60,C63,C72,C73,C86,C87,C9,D1,D10,D4,D9
`Chr7:34442077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B106,B20,B39,B69,C3
`Chr7:34442077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B20,B39,B69,C3
`Chr7:34442237`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B20,D10
`Chr7:34442237`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B20,D10
`Chr7:34442242`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B20,D10
`Chr7:34442242`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B20,D10
`Chr7:34442244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,D10
`Chr7:34442281`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B20,B64
`Chr7:34442281`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B20,B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775160.1

320 aa

160

320

RVT_2

PF07727 RVT_2 217-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775160.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	217	316	8.1e-27	95.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919177.1
ATGTCTGGACCCTACCAATCTCAGCTCAAACGAAATCAGTTTGATGCTCCACACTTTCAGTCGAGATGCTATCAGTCAGGAACTACTTCAGTATCTCAAAGGAGATACAATACTGATCAGAGAAGACCTCCAATTTATACAAGACCTAACTACAAGAAGAAGGAGGTTCCAAAGAAGAAAGTTGATCAACCAAGAAGAGCTCATGTGCTGACTGAAGAAGCCTCAACTTCAGGCAAATCTATGAAACACAAAAAGAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994147
ATGTCTGGACCCTACCAATCTCAGCTCAAACGAAATCAGTTTGATGCTCCACACTTTCAGTCGAGATGCTATCAGTCAGGAACTACTTCAGTATCTCAAAGGAGATACAATACTGATCAGAGAAGACCTCCAATTTATACAAGACCTAACTACAAGAAGAAGGAGGTTCCAAAGAAGAAAGTTGATCAACCAAGAAGAGCTCATGTGCTGACTGAAGAAGCCTCAACTTCAGGCAAATCTATGAAACACAAAAAGAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775160.1
MSGPYQSQLKRNQFDAPHFQSRCYQSGTTSVSQRRYNTDQRRPPIYTRPNYKKKEVPKKKVDQPRRAHVLTEEASTSGKSMKHKKKEEVKAPRNTWKQETEENAKNNGVSSTEKKSTEKRRCSTEVITESISQGGTPPTKEHKEAETGVHVEPNSPLVPQSPARGETEATIKLQSTTDGPRPILTEEPPPSPKGIKKYRKCCFLSQTKLKDVEEALKYIQWNKKDEKGNRVRNKARLVAKRYSPEEGIDYDETFALVARL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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