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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003273`

染色体: Chr07 坐标: 34496729-34500539 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003273`
名称	SmilChr07G003273
描述	cyclin-SDS
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34496729 - 34500539 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994148`
GeneID	`130994148`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994148`
原始查询	`SmilChr07G003273`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-SDS
产物	cyclin-SDS
Arabidopsis	`AT1G14750` (SDS) Cyclin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838040] identity=40.8; qcov=1; evalue=3.44e-115; confidence=medium
Rice	`Os03g0225200` (OsSDS) - identity=50.5; qcov=0.466; evalue=2.1e-82; confidence=medium
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016538 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity); GO:0044772 (mitotic cell cycle phase transition)
KEGG	-
Pfam	PF00134 (Cyclin_N); PF02984 (Cyclin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994148

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775161.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775161.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775161.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775161.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775161.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34497401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:34498466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:34498958`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	193	A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A22,A23,A25,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B138,B139,B140,B15,B16,B18,B21,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B46,B47,B48,B49,B51,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B62,B63,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B95,B96,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C21,C24,C25,C27,C28,C29,C3,C30,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C46,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C60,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C77,C79,C83,C84,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D7,D8,D9
`Chr7:34499064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B86
`Chr7:34499644`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	191	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B10,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B111,B112,B117,B119,B12,B120,B121,B123,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B6,B60,B61,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B73,B74,B75,B76,B77,B79,B8,B80,B83,B85,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C26,C29,C30,C31,C32,C33,C35,C37,C4,C40,C41,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C71,C73,C74,C76,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C84,C87,D11,D2,D5,D6,D8
`Chr7:34499906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr7:34500036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr7:34500198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775161.1

586 aa

293

586

Cyclin_N

Cyclin_C

PF00134 Cyclin_N 363-491 aa PF02984 Cyclin_C 495-582 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775161.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	363	491	9.4e-18	64.9	Cyclin, N-terminal domain
`XP_057775161.1`	Pfam	`PF02984`	Cyclin_C	Domain	495	582	1.1e-11	45.5	Cyclin, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919178.1
TTCGATCGCGTCGCTGTTGAGGCGAAAACTCTTCCTTCAGCGATGAAGCGCAAGCTCACTGCTAAACATGTTTCAGAAATCGAAGAGCAATCGCTCTGTTTCAGGCGGAAGCAGCTCCGATCGCAGCTCAGTCGCCGGCGGCGGCTTCACATCTCACCTCTCGTTGTGTTTTCCGGAAACGAGTCACATTTTGCAACAGTGAGTGAGGTCTCGTGTGACTCTAGCATCGCCTCGGTGAGCAATCTGAATCCGCCGGAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994148
TTCGATCGCGTCGCTGTTGAGGCGAAAACTCTTCCTTCAGCGATGAAGCGCAAGCTCACTGCTAAACATGTTTCAGAAATCGAAGAGCAATCGCTCTGTTTCAGGCGGAAGCAGCTCCGATCGCAGCTCAGTCGCCGGCGGCGGCTTCACATCTCACCTCTCGTTGTGTTTTCCGGAAACGAGTCACATTTTGCAACAGTGAGTGAGGTCTCGTGTGACTCTAGCATCGCCTCGGTGAGCAATCTGAATCCGCCGGAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775161.1
FDRVAVEAKTLPSAMKRKLTAKHVSEIEEQSLCFRRKQLRSQLSRRRRLHISPLVVFSGNESHFATVSEVSCDSSIASVSNLNPPETQDKCQRIVTRSYYRKNFKNASRNQDEAVELSDVSCVESCSGTNRDLNLKSSNVEELEVGVGVTKSEVSSASRFSFPANDATVKENESSAGTTQSEVVFEIPGVNEISCEEITASEAERDNSAKNGRVLLNSAARATKISESGDASEEIRPPNLVAFDFDLACSEQFSSGGVTN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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