当前解析结果
SmilChr07G003285| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003285 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003285 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003285 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 34593221 - 34594768 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130996158 |
|---|---|
| GeneID | 130996158 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996158 |
| 原始查询 | SmilChr07G003285 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996158 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057777650.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057777650.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777650.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777650.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057777650.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:34593258 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 29 | A13,A20,A21,B1,B11,B117,B131,B22,B23,B33,B40,B55,B6,B67,B83,B84,C11,C13,C2,C33,C35,C37,C51,C53,C61,C62,C67,C87,D2 |
Chr7:34593359 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:34593364 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B46 |
Chr7:34593376 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,C37 |
Chr7:34594429 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B40,B58,C16,C33,C62 |
Chr7:34594452 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B46,B49 |
Chr7:34594487 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B46,B49 |
Chr7:34594539 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A1,B130,B22,B75 |
Chr7:34594542 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A1,B130,B22,B75 |
Chr7:34594559 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 122 | A10,A15,A18,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B101,B102,B103,B104,B105,B109,B11,B111,B113,B114,B117,B120,B122,B123,B124,B126,B127,B13,B133,B138,B14,B15,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B24,B26,B29,B30,B31,B32,B34,B35,B37,B40,B42,B43,B44,B45,B48,B5,B51,B52,B55,B56,B58,B59,B61,B62,B66,B68,B70,B72,B73,B78,B82,B85,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B96,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C26,C27,C29,C3,C33,C39,C42,C43,C44,C45,C47,C5,C51,C53,C55,C59,C62,C71,C74,C76,C77,C80,C81,C82,C84,C85,C87,C9,D1,D5,D8 |
Chr7:34594580 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 22 | A19,B1,B106,B124,B125,B17,B21,B25,B7,B77,B80,B89,C11,C35,C40,C49,C50,C65,C69,C70,C86,D11 |
Chr7:34594611 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C65 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。