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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003292`

染色体: Chr07 坐标: 34682889-34686107 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003292`
名称	SmilChr07G003292
描述	ABC transporter I family member 10-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34682889 - 34686107 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996164`
GeneID	`130996164`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996164`
原始查询	`SmilChr07G003292`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter I family member 10-like
产物	ABC transporter I family member 10-like
Arabidopsis	`AT4G33460` (ABCI10) ABC transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829483] identity=64.9; qcov=1.02; evalue=6.32e-127; confidence=high
Rice	`Os01g0770500` (OsABCI6) - identity=63.7; qcov=0.944; evalue=1.15e-116; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0009941 (chloroplast envelope); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00005 (ABC_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996164

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057777656.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777656.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777656.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777656.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777656.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34683032`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A3,A4,A9,B103,B30,B42,B52,B56,B65,B68,B86,B89,C1,C15,C20,C23,C26
`Chr7:34683038`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A3,A4,A9,B103,B30,B42,B52,B56,B65,B68,B86,B89,C1,C15,C20,C23,C26
`Chr7:34683041`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A3,A4,A9,B103,B30,B42,B52,B56,B58,B65,B68,B86,B89,C1,C15,C20,C23,C26
`Chr7:34683161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,C60
`Chr7:34683212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B122,B131,C2
`Chr7:34684123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C50,C86
`Chr7:34684141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr7:34684202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C77
`Chr7:34684391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C41
`Chr7:34684393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr7:34684404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B61,C19,C31
`Chr7:34685394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777656.1

266 aa

133

266

ABC_tran

PF00005 ABC_tran 57-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777656.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	57	189	1e-27	98.1	ABC transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921673.1
GAAAACACAGTTTATGGTAATCAAACATGGCAGAATAAATATTTTATCTTGAACACAATCCATGGCGTAATCTCTTGTTTCCTTAGACAATGAACGCGACCGCCATGGTTCGCGCCACCGCGGCCGTGCAATTTCCACTTCACCGTGTTCACTCCAGCGGAGACAATTACACCGCCACCGTCGCCACCACTTCAGCAATAGAATGTCGGAATCTCAGCTACTCCGTTAGGACTCGGCAGGGAAATTTTGTCCCAGTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996164
ATGAACGCGACCGCCATGGTTCGCGCCACCGCGGCCGTGCAATTTCCACTTCACCGTGTTCACTCCAGCGGAGACAATTACACCGCCACCGTCGCCACCACTTCAGCAATAGAATGTCGGAATCTCAGCTACTCCGTTAGGACTCGGCAGGGAAATTTTGTCCCAGTTCTCACCGATTGCTCTCTCAGCATTCCATCTGGACAGTTCTGGATGCTTCTAGGCCCCAATGGTTGCGGGAAATCTACCCTTCTAAAGATTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777656.1
MNATAMVRATAAVQFPLHRVHSSGDNYTATVATTSAIECRNLSYSVRTRQGNFVPVLTDCSLSIPSGQFWMLLGPNGCGKSTLLKILGGLLNPSGGYLHVKKPRSFVFQNPDHQVVMPTVEVDVAFGLGKFSMANDEITSRVAKALDAVGMHEYLQRPIQTLSGGQKQRVAIAGALAEACKVLLLDELTSFLDEDDQVGVVRAVQSSVASSKGTTALWVTHRLEELEYADGAVYMEDGKVVLQGNASTIKNFVESKQASY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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