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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003293`

染色体: Chr07 坐标: 34720843-34724493 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003293`
名称	SmilChr07G003293
描述	receptor protein kinase TMK1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34720843 - 34724493 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996163`
GeneID	`130996163`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996163`
原始查询	`SmilChr07G003293`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor protein kinase TMK1-like
产物	receptor protein kinase TMK1-like
Arabidopsis	`AT1G66150` (TMK1) transmembrane kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842930] identity=63.9; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0717000` (OsTMK) - identity=63.1; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2); PF12799 (LRR_4); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996163

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777655.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777655.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777655.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777655.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777655.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34721222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D6
`Chr7:34721368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:34721461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B82,C37,C6,C77
`Chr7:34721538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr7:34721730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C6
`Chr7:34721924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B111,B122,B131,C2
`Chr7:34722337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:34722364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C77
`Chr7:34722415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B111,B122
`Chr7:34722457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B75,D9
`Chr7:34722510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C77
`Chr7:34722551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B75,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777655.1

941 aa

470

941

LRRNT_2

LRR_8

LRR_1

LRRNT_2

LRR_8

LRR_4

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 23-57 aa PF13855 LRR_8 85-142 aa PF00560 LRR_1 108-129 aa PF00560 LRR_1 183-203 aa PF00560 LRR_1 256-278 aa PF08263 LRRNT_2 326-361 aa PF13855 LRR_8 382-423 aa PF12799 LRR_4 387-423 aa PF00560 LRR_1 388-410 aa PF00069 Pkinase 586-858 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 589-860 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777655.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	23	57	2.1e-11	44.6	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057777655.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	85	142	1.3e-21	76.8	Leucine rich repeat
`XP_057777655.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	108	129	3.1e-22	74.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057777655.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	183	203	3.1e-22	74.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057777655.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	256	278	3.1e-22	74.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057777655.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	326	361	2.1e-11	44.6	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057777655.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	382	423	1.3e-21	76.8	Leucine rich repeat
`XP_057777655.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	387	423	3.2e-22	78.8	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057777655.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	388	410	3.1e-22	74.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057777655.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	586	858	6.3e-45	154.3	Protein kinase domain
`XP_057777655.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	589	860	9.1e-47	160.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921672.1
ATTCACTCTCAGCCCTCTTTTATGGGGAAGAAAAGCTCACACTACTTTCTATATTCCCTCTTTCACCGTCGCCTCACACCACGCACACTACTTTCCTCTCTCACCTTTCAAAAACCCTACGCTAAATTTTTCCCCTTTTCCATTTCTCAGCAGATTATCCTCTTCTCTTCTCTCAACACCCCACAATTTAACATCTGAAACAAAGAATTCCTCACGAGGAAAATAATCTCATCTACAAACGGAGCATCGTTTTCTCGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996163
ATGGCGTTAAGTTTGATTTTCTTCGCCGTCTGTTCATTTCTAGCCGCCGTCGCCCGCTCCCAATCCGGCGACGCGGCGGTTATGCAGGAATTGAAGAAGAGCATCAACGCTCCGAGTGAACTCGGGTGGAGCGACGCCGACCCCTGCAAATGGAAGTCCGTTCAGTGCACACGAGACAACCGGGTCACCCGGATCCAAATCGGGCACCAAAACCTGGAGGGGTCGCTGCCTCCGTCCCTCGGCAAACTCACCTCCCTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777655.1
MALSLIFFAVCSFLAAVARSQSGDAAVMQELKKSINAPSELGWSDADPCKWKSVQCTRDNRVTRIQIGHQNLEGSLPPSLGKLTSLQVFEVQNNQLSGALPSLAGLNSLQSLLLSNNNFTSIPPDFFDGMISLQDVYLDSNPFSSWQIPAGLKSASTLQMFSATSANISGQLPDFFGSDTFPSLTSLRLSFNYIQGPLPPSFAGSSIQTLWLNGQRSGNGMNGSISILQNMTQLTQIWLHSNDFSGPLPDFTALIQLQNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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