当前解析结果
SmilChr07G003295| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003295 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003295 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003295 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 34763295 - 34769886 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994155 |
|---|---|
| GeneID | 130994155 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994155 |
| 原始查询 | SmilChr07G003295 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994155 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775168.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057775168.1 |
| 3 | Nuclear speckle | 核斑点 | 0.40000 | XP_057775168.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057775168.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775168.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:34763295 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B3,B45,C46,C52 |
Chr7:34763295 |
T |
TC |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | B3,B45,C46,C52 |
Chr7:34763299 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B31,B69,C13,C72 |
Chr7:34763311 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,B43,B73,C55 |
Chr7:34763314 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B130,B29 |
Chr7:34763320 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B95 |
Chr7:34763320 |
C |
CG |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr7:34763322 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B27,C43 |
Chr7:34763324 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B62,B98 |
Chr7:34763324 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B62,B98 |
Chr7:34763347 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B95 |
Chr7:34763347 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B95 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。