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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003301`

染色体: Chr07 坐标: 34869196-34874379 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003301`
名称	SmilChr07G003301
描述	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD12-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34869196 - 34874379 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994157`
GeneID	`130994157`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994157`
原始查询	`SmilChr07G003301`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD12-like
产物	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD12-like
Arabidopsis	`AT4G21160` (ZAC) Calcium-dependent ARF-type GTPase activating protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827864] identity=64.5; qcov=0.707; evalue=3.07e-97; confidence=high
Rice	`Os02g0722500` - identity=58.9; qcov=0.681; evalue=2.44e-81; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0005543 (phospholipid binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00168 (C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994157

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775170.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775170.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057775170.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775170.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775170.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34869198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr7:34869199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr7:34869200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:34869206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B74,B95,C40,C42
`Chr7:34869213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr7:34869245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr7:34869262`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B73
`Chr7:34869262`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B73
`Chr7:34869297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B2,C61,D8
`Chr7:34869299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,C20,C87
`Chr7:34869311`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr7:34869311`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775170.1

307 aa

154

307

PF00168 C2 153-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775170.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	153	240	3.8e-23	82.4	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919187.1
ATGGCTGATGGCCGGAGGTTCAAGTTGTTTGGAAACATCATGTCTCAGAGAGTCTTGTTGGCGTTGTCATTCTGCCCTTCCGAATTTTCTACCATCTCTCTCTCCGCTTCTAACTGTCTCTCTCTTGCCTGTGCCTCTTGTTCTGCCCTGCGTCTAGCATCGTTGTTCTGTCGAACAAGTCGCTCGATCTCCTCGTGGAACAAAAGATCTTCGTTACCTGCACTCCTGCTAAGTTTCCTATCCCATCCACTGCAGCTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994157
ATGGCTGATGGCCGGAGGTTCAAGTTGTTTGGAAACATCATGTCTCAGAGAGTCTTGTTGGCGTTGTCATTCTGCCCTTCCGAATTTTCTACCATCTCTCTCTCCGCTTCTAACTGTCTCTCTCTTGCCTGTGCCTCTTGTTCTGCCCTGCGTCTAGCATCGTTGTTCTGTCGAACAAGTCGCTCGATCTCCTCGTGGAACAAAAGATCTTCGTTACCTGCACTCCTGCTAAGTTTCCTATCCCATCCACTGCAGCTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775170.1
MADGRRFKLFGNIMSQRVLLALSFCPSEFSTISLSASNCLSLACASCSALRLASLFCRTSRSISSWNKRSSLPALLLSFLSHPLQLKISSCSITDFYSLCDLCRSKYEQQAFLKPSLRIQSGSAKQSLQASLSRKIVNSLRSSNSSENSEYIGTMKVKVLKGSNLAVRDMLSSDPYIVLTLGQQKVQTSVVNSYLNPVWNEELTLSIPHDYSQVKLQVYDHDTFSADDIMGEADIDIQPMITSALAYGDARKFADMQIGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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