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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003305`

染色体: Chr07 坐标: 35050981-35054963 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003305`
名称	SmilChr07G003305
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	35050981 - 35054963 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996172`
GeneID	`130996172`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996172`
原始查询	`SmilChr07G003305`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27
Arabidopsis	`AT3G09180` (AT3G09180) mediator of RNA polymerase II transcription subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820074] identity=61.3; qcov=0.9; evalue=2.94e-137; confidence=high
Rice	`Os01g0263500` (OsMed3_1) - identity=60.2; qcov=0.884; evalue=1.56e-129; confidence=high
GO	GO:0003713 (transcription coactivator activity); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016592 (mediator complex)
KEGG	-
Pfam	PF11571 (Med27)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996172

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777663.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057777663.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777663.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057777664.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777663.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:35051175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr7:35051233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:35052333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr7:35052412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr7:35053368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B52,B86,C79
`Chr7:35054582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A9,B35,B85,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777663.1

408 aa

204

408

Med27

PF11571 Med27 305-403 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777663.1`	Pfam	`PF11571`	Med27	Family	305	403	5.3e-18	65.9	Mediator complex subunit 27

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921680.1
GTAAGAGAGTATATTTTGAAGTGAGTAAGAGAGCATCTTAAACCTAAGAAAATGTCCCAAATAAATGCGGCCCAAACCATTGATTTGATAAGCGATCTTTGACGGAATTTCTCGTCGAGAAAGCAGGAGACGATTCTTCTTTCAAAACCCCCAAAATCGAAGCCAAATGCAGCAGGCAGTTCCTCCACCACCGGCTCAGGAGGCGGCGCCGCCGCCAGCGGGGAATGCCCCGCCCAAGCAGGTGGCTCAAGCGTTGGAGC...

XM_057921681.1
TTTTGAAGTGAGTAAGAGAGCATCTTAAACCTAAGAAAATGTCCCAAATAAATGCGGCCCAAACCATTGATTTGATAAGCGATCTTTGACGGAATTTCTCGTCGAGAAAGCAGGAGACGATTCTTCTTTCAAAACCCCCAAAATCGAAGCCAAATGCAGCAGGCAGTTCCTCCACCACCGGCTCAGGAGGCGGCGCCGCCGCCAGCGGGGAATGCCCCGCCCAAGCAGGTGGCTCAAGCGTTGGAGCAGCTTGGTCAGGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996172
ATGCAGCAGGCAGTTCCTCCACCACCGGCTCAGGAGGCGGCGCCGCCGCCAGCGGGGAATGCCCCGCCCAAGCAGGTGGCTCAAGCGTTGGAGCAGCTTGGTCAGGCGGGACGCCTGATTGCCGATGTGCGGCTGGGCGCGGACCGGTTACTGGAAGCCTTGTCCTTCGTGGCGGAGAAGCCTCACCACCAATATTCTGCTAAGTGTTTAAATTTAATCCTCAAAGAAGAATCCCTAATGCGCCAACACCTCGTGAACCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777663.1
MQQAVPPPPAQEAAPPPAGNAPPKQVAQALEQLGQAGRLIADVRLGADRLLEALSFVAEKPHHQYSAKCLNLILKEESLMRQHLVNLRAIGRQLEESGVLNDSLRSRSNSWGLHMPLVCPDGAVVAYAWKRQLAGQAGASAVDRTRLALKAFTDQKRQFFPHLADDSVVESATKKHCSPLPISYEEIGDLKTVGDILSHLEKEVPNLQASTYQRMDWLKRASSLPSAANESSTESTKDLSFPSTSKWRQRSEMHAADEAA...

XP_057777664.1
MQQAVPPPPAQEAAPPPAGNAPPKQVAQALEQLGQAGRLIADVRLGADRLLEALSFVAEKPHHQYSAKCLNLILKEESLMRQHLVNLRAIGRQLEESGVLNDSLRSRSNSWGLHMPLVCPDGAVVAYAWKRQLAGQAGASAVDRTRLALKAFTDQKRQFFPHLADDSVVESATKKHCSPLPISYEEIGDLKTVGDILSHLEKEVPNLQASTYQRMDWLKRASSLPSAANESSTESTKDLSFPSTSKWRQRSEMHAADEAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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