当前解析结果
SmilChr07G003312| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003312 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003312 |
| 描述 | annexin D5 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 35154201 - 35157770 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130996179 |
|---|---|
| GeneID | 130996179 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996179 |
| 原始查询 | SmilChr07G003312 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | annexin D5 |
| 产物 | annexin D5 |
| Arabidopsis | AT1G68090 (ANN5)annexin 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843137] identity=56.5; qcov=0.987; evalue=2.97e-132; confidence=high |
| Rice | Os09g0394900 (OsANN9)- identity=68.8; qcov=0.991; evalue=4.72e-160; confidence=high |
| GO | GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005544 (calcium-dependent phospholipid binding); GO:0005737 (cytoplasm) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00191 (Annexin) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996179 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057777674.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057777674.1 |
| 3 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057777674.1 |
| 4 | Cell projection | 细胞突起 | 0.20000 | XP_057777674.1 |
| 5 | Pseudopodium | Pseudopodium | 0.20000 | XP_057777675.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:35154925 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B24,B53 |
Chr7:35156262 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr7:35156284 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr7:35156561 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:35157519 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777674.1PF00191
Annexin 16-75 aa
PF00191
Annexin 88-152 aa
PF00191
Annexin 171-237 aa
PF00191
Annexin 247-312 aa
XP_057777675.1PF00191
Annexin 16-79 aa
PF00191
Annexin 87-151 aa
PF00191
Annexin 170-236 aa
PF00191
Annexin 246-311 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777674.1 |
Pfam | PF00191 |
Annexin | Domain | 16 | 75 | 1e-76 | 253.7 | Annexin |
XP_057777674.1 |
Pfam | PF00191 |
Annexin | Domain | 88 | 152 | 1e-76 | 253.7 | Annexin |
XP_057777674.1 |
Pfam | PF00191 |
Annexin | Domain | 171 | 237 | 1e-76 | 253.7 | Annexin |
XP_057777674.1 |
Pfam | PF00191 |
Annexin | Domain | 247 | 312 | 1e-76 | 253.7 | Annexin |
XP_057777675.1 |
Pfam | PF00191 |
Annexin | Domain | 16 | 79 | 1.5e-78 | 259.5 | Annexin |
XP_057777675.1 |
Pfam | PF00191 |
Annexin | Domain | 87 | 151 | 1.5e-78 | 259.5 | Annexin |
XP_057777675.1 |
Pfam | PF00191 |
Annexin | Domain | 170 | 236 | 1.5e-78 | 259.5 | Annexin |
XP_057777675.1 |
Pfam | PF00191 |
Annexin | Domain | 246 | 311 | 1.5e-78 | 259.5 | Annexin |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。