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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003323`

染色体: Chr07 坐标: 35477813-35478363 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003323`
名称	SmilChr07G003323
描述	uncharacterized protein At5g19025-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	35477813 - 35478363 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994160`
GeneID	`130994160`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994160`
原始查询	`SmilChr07G003323`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819792]; symbol=AT3G06180; hit=AT3G06180; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819792]; symbol=AT3G06180; hit=AT3G06180; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G06180` (AT3G06180) Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819792] identity=50.7; qcov=0.76; evalue=4.19e-22; confidence=medium
Rice	`Os05g0393200` - identity=46.8; qcov=0.263; evalue=5.44e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28125 (At5g19025_N); PF30682 (At5g19025_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994160

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057775175.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057775175.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057775175.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057775175.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775175.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:35477826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr7:35477829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr7:35477851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr7:35477860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:35477871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B100,C43,C77
`Chr7:35477899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B15,C28
`Chr7:35477902`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B45
`Chr7:35477902`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B45
`Chr7:35477915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B47,C24,C59
`Chr7:35477921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr7:35477944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:35477945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B17,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775175.1

179 aa

179

At5g19025_N

At5g19025_C

PF28125 At5g19025_N 47-127 aa PF30682 At5g19025_C 139-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775175.1`	Pfam	`PF28125`	At5g19025_N	Domain	47	127	4.4e-17	63.4	At5g19025 N-terminal domain
`XP_057775175.1`	Pfam	`PF30682`	At5g19025_C	Domain	139	171	2e-06	28.1	At5g19025 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919192.1
TTATCACTAACATGCGCCATCTCCACCACTCCATCACCGCCATGGCCCCTTCCTCCTCCCTCAGAAAAACCCCAATTCCAAAAACCCCCGCCCCCAACCACCCGAATTCCCCAAACTGCCCCTCCCTCTGCCGCCACTCGCCCTCCGCCACTCTTGACCTCCTCATCTTCATCCTCGTCCTCTTCTCCGGCGCCTTCCTCATCGTCTCCTGCTTCTCCTATCTCTTCCAGTCGCTCTCTCTCATCCTACCCCCTTTCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994160
ATGCGCCATCTCCACCACTCCATCACCGCCATGGCCCCTTCCTCCTCCCTCAGAAAAACCCCAATTCCAAAAACCCCCGCCCCCAACCACCCGAATTCCCCAAACTGCCCCTCCCTCTGCCGCCACTCGCCCTCCGCCACTCTTGACCTCCTCATCTTCATCCTCGTCCTCTTCTCCGGCGCCTTCCTCATCGTCTCCTGCTTCTCCTATCTCTTCCAGTCGCTCTCTCTCATCCTACCCCCTTTCTCCAACGTGGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775175.1
MRHLHHSITAMAPSSSLRKTPIPKTPAPNHPNSPNCPSLCRHSPSATLDLLIFILVLFSGAFLIVSCFSYLFQSLSLILPPFSNVAAHFHRHFAFNPQSQLIFFTLSAVSFVGFVIFFEICCGHRSRRKGCRGLKKAMEFDLQLQGEELLRSGDGNKAVRDVNELSWKGGGGLHGVSVV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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