当前解析结果
SmilChr07G003324| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003324 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003324 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003324 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 35480028 - 35480555 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130996187 |
|---|---|
| GeneID | 130996187 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996187 |
| 原始查询 | SmilChr07G003324 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0610200; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os04g0610200; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0610200- identity=22.9; qcov=1.17; evalue=3.45e-06; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996187 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057777682.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777682.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777682.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057777682.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057777682.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:35480124 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,B57,B78 |
Chr7:35480128 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr7:35480134 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B81,C51 |
Chr7:35480143 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B26,B81,C28,C51 |
Chr7:35480145 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B64 |
Chr7:35480171 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr7:35480194 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 17 | A1,A6,A8,B115,B28,B37,B41,B57,B64,B78,B84,C16,C18,C20,C55,C8,C80 |
Chr7:35480247 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr7:35480279 |
TAG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B12,C43 |
Chr7:35480279 |
TAG |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B12,C43 |
Chr7:35480282 |
G |
GCT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B12,C43 |
Chr7:35480282 |
G |
GCT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B12,C43 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。