当前解析结果
SmilChr07G003347| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003347 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003347 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003347 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 35912873 - 35914375 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994163 |
|---|---|
| GeneID | 130994163 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994163 |
| 原始查询 | SmilChr07G003347 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=30.1; qcov=0.573; evalue=1.24e-33; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994163 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775179.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057775179.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057775179.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775179.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775179.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:35912883 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:35912929 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B52,C55 |
Chr7:35912993 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A24,B134 |
Chr7:35913001 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B8,C48 |
Chr7:35913019 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C65 |
Chr7:35913041 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr7:35913047 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,B3 |
Chr7:35913062 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,C3 |
Chr7:35913068 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B15,B27,B6 |
Chr7:35913070 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B3 |
Chr7:35913077 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B1,B36,B39,B51,C64 |
Chr7:35913083 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。