当前解析结果
SmilChr07G003369| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003369 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003369 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003369 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 36297064 - 36298039 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994168 |
|---|---|
| GeneID | 130994168 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994168 |
| 原始查询 | SmilChr07G003369 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=39.5; qcov=0.577; evalue=4.62e-20; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994168 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775184.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057775184.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057775184.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775184.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775184.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:36297070 |
GTA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B106,B139,C60 |
Chr7:36297070 |
GTA |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | B106,B139,C60 |
Chr7:36297091 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,B120,B40 |
Chr7:36297111 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B134,D11,D9 |
Chr7:36297119 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B76,C29,C37,C69 |
Chr7:36297134 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr7:36297154 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | B106,B117,B42,B58,B71,B80,B83,B89,C37,C57,C77 |
Chr7:36297168 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B53,C4 |
Chr7:36297216 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr7:36297219 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B52,C55 |
Chr7:36297226 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 19 | A13,A9,B105,B118,B135,B16,B43,B49,B52,B72,B91,C19,C38,C43,C44,C47,C50,C55,C86 |
Chr7:36297233 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。