当前解析结果
SmilChr07G003377| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003377 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003377 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003377 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 36463768 - 36465132 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994173 |
|---|---|
| GeneID | 130994173 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994173 |
| 原始查询 | SmilChr07G003377 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994173 |
特征证据限制:抽查两个保留的历史缓存共 206 行,PROFEAT 特征全部为零;第二块缓存为 106 行,比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实,不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测,也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选,特征完整性与预测可靠性尚未建立。
| Rank | 定位位置 | 中文 | 五折投票比例 | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775189.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057775189.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057775189.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:36463806 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr7:36463808 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr7:36463841 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A7 |
Chr7:36463910 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B45,C63 |
Chr7:36463941 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A6,C65,D11 |
Chr7:36463971 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,C21,C36 |
Chr7:36463993 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A6,B45,C63,C65,D11 |
Chr7:36463999 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,B131,B16,B46 |
Chr7:36464007 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | A8,B45,C57,C87 |
Chr7:36464007 |
C |
CT |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | A8,B45,C57,C87 |
Chr7:36464011 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | A8,C57,C87 |
Chr7:36464011 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | A8,C57,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。