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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003378`

染色体: Chr07 坐标: 36481870-36483537 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003378`
名称	SmilChr07G003378
描述	uncharacterized SmilChr07G003378
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	36481870 - 36483537 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994174`
GeneID	`130994174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994174`
原始查询	`SmilChr07G003378`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=24.8; qcov=0.63; evalue=7.77e-23; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775190.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057775190.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057775190.1`
4	P-body	P-body	0.40000	`XP_057775190.1`
5	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057775190.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:36481872`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A11,A6,B103,B115,B120,B121,B131,B137,B18,B20,B27,B37,B54,B60,B75,B78,B90,B92,B97,C18,C20,C51,C65,C69,C7,C75,D5,D6
`Chr7:36481875`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	86	A10,A13,A14,A19,A2,A21,A3,A7,A9,B102,B104,B109,B11,B117,B124,B128,B129,B132,B134,B139,B14,B2,B22,B23,B28,B35,B4,B43,B45,B47,B48,B51,B52,B57,B6,B61,B62,B65,B69,B7,B71,B72,B76,B80,B81,B82,B83,B86,B9,B95,B96,C1,C11,C13,C15,C16,C19,C2,C23,C24,C28,C32,C33,C35,C39,C4,C43,C45,C47,C49,C50,C52,C58,C60,C61,C67,C68,C71,C73,C74,C76,C79,C80,C9,D10,D9
`Chr7:36481888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr7:36481939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr7:36481941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr7:36481950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C43,C83,C86
`Chr7:36481974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C61
`Chr7:36482007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B18
`Chr7:36482007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr7:36482031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C76
`Chr7:36482043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B25
`Chr7:36482057`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B105

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775190.1

538 aa

269

538

DUF4283

PF14111 DUF4283 88-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775190.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	88	172	1.4e-08	35.1	Domain of unknown function (DUF4283)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919207.1
ATGACCAAGGATAATCATGACATGAATTTGAACGATAGTTCGAAAGAGCACGACGACAGTCTTCATGTGCTAGAGAGAAATAAGGACACGCAGAAGGCTAAGCAGATTTACGATCGTCCATCATATGCGAATGTCATCAGGCCTGTTAGTTCCAGAAAACCGGACGTCCTTGTCCATAGATGTGCCACAGTTTGCCCCGAAGTTATTAACGGAGTTATTTCTCTTAAAATTCCGGAAACTATGTATCAAGATTGGGTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994174
ATGACCAAGGATAATCATGACATGAATTTGAACGATAGTTCGAAAGAGCACGACGACAGTCTTCATGTGCTAGAGAGAAATAAGGACACGCAGAAGGCTAAGCAGATTTACGATCGTCCATCATATGCGAATGTCATCAGGCCTGTTAGTTCCAGAAAACCGGACGTCCTTGTCCATAGATGTGCCACAGTTTGCCCCGAAGTTATTAACGGAGTTATTTCTCTTAAAATTCCGGAAACTATGTATCAAGATTGGGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775190.1
MTKDNHDMNLNDSSKEHDDSLHVLERNKDTQKAKQIYDRPSYANVIRPVSSRKPDVLVHRCATVCPEVINGVISLKIPETMYQDWVKQFQHALIGRFLLRKGEKPRLASDLKTELHNTWKSKSDWQLIPMSKGFYTFKFSTAEDKSIAKRSNFWNLSSGTLRLREWVRNFDPYKEISSLCQVWMRIYYLPVEYWTKEIISSIGRSVGMPIKVDGATADGDIGHFAMVLVEVDLGLPLPESASIDCPDSFFVEFGYEQLPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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