当前解析结果
SmilChr07G003386| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003386 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003386 |
| 描述 | gibberellin 2-beta-dioxygenase 6-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 36693420 - 36693950 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994177 |
|---|---|
| GeneID | 130994177 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994177 |
| 原始查询 | SmilChr07G003386 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | gibberellin 2-beta-dioxygenase 6-like |
| 产物 | gibberellin 2-beta-dioxygenase 6-like |
| Arabidopsis | AT4G21200 (GA2OX8)gibberellin 2-oxidase 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827868] identity=42.2; qcov=0.875; evalue=4.09e-36; confidence=medium |
| Rice | Os04g0522500 (OsGA2ox6)- identity=43; qcov=0.886; evalue=4.15e-33; confidence=medium |
| GO | GO:0051213 (dioxygenase activity) |
| KEGG | smil00904 (Diterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF14226 (DIOX_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994177 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775192.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775192.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057775192.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775192.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775192.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057775192.1PF14226
DIOX_N 37-137 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057775192.1 |
Pfam | PF14226 |
DIOX_N | Family | 37 | 137 | 7.3e-19 | 69.3 | non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。