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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003390`

染色体: Chr07 坐标: 36716733-36720321 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003390`
名称	SmilChr07G003390
描述	uncharacterized SmilChr07G003390
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	36716733 - 36720321 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994180`
GeneID	`130994180`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994180`
原始查询	`SmilChr07G003390`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=48.5; qcov=0.914; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0301400` - identity=33.9; qcov=0.722; evalue=2.1e-81; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994180

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775196.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057775196.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775196.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775196.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775196.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:36716824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr7:36716933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B137,B139,B56,B96
`Chr7:36716958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B93
`Chr7:36716958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:36716960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:36717453`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr7:36717453`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr7:36717620`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B7,C17,C27
`Chr7:36717620`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B7,C17,C27
`Chr7:36717669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B138,B26,C87
`Chr7:36717807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B108,D10
`Chr7:36717859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B30,C21,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775196.1

695 aa

348

695

DUF4371

PF14291 DUF4371 78-183 aa PF14291 DUF4371 182-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775196.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	78	183	6.8e-65	219.6	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057775196.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	182	228	6.8e-65	219.6	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919213.1
ATGAAACGGTATTTTCATCACATACCTTCAACAAGTGTAGATGGTTCATCTTCAACGGTTAATGGTCCTACTACACATGTTGAGCCTGGAGCAACATCAGCACAAGTGAATATTGAAGTTGATCTTCAACCTGAACCATCTTCAAAAGTGGTTGATTTATTAAATCTGCCAAGTGATCCGGGACTACGACCTAACATAATGAGCTATCCTCCAAACATGATCGAGCAGATAGCATCAATAAAGTGTCTCCGCTATCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994180
ATGAAACGGTATTTTCATCACATACCTTCAACAAGTGTAGATGGTTCATCTTCAACGGTTAATGGTCCTACTACACATGTTGAGCCTGGAGCAACATCAGCACAAGTGAATATTGAAGTTGATCTTCAACCTGAACCATCTTCAAAAGTGGTTGATTTATTAAATCTGCCAAGTGATCCGGGACTACGACCTAACATAATGAGCTATCCTCCAAACATGATCGAGCAGATAGCATCAATAAAGTGTCTCCGCTATCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775196.1
MKRYFHHIPSTSVDGSSSTVNGPTTHVEPGATSAQVNIEVDLQPEPSSKVVDLLNLPSDPGLRPNIMSYPPNMIEQIASIKCLRYLLMQGMAFRGHDESEESLNQGNFMELLKLLASCSKEISNVVLKNAPENLKLTSPDIQKDIINAIAVETTRAIIDDIGNDFFAILVDECRDVSVKEQMVHVSDTIATSLEKGIDSLFSTYGLSISSLRGQGYDGASNMRGEFSGLKTLILKRNPNAYYVHCFAHQLQLTIVAVAKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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