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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003398`

染色体: Chr07 坐标: 36870640-36871329 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003398`
名称	SmilChr07G003398
描述	uncharacterized SmilChr07G003398
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	36870640 - 36871329 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994182`
GeneID	`130994182`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994182`
原始查询	`SmilChr07G003398`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG01250` - identity=33.6; qcov=0.48; evalue=1.62e-14; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=32.6; qcov=1; evalue=9.21e-35; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994182

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775198.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057775198.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775198.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775198.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775198.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:36870667`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	78	A13,A18,A19,A2,A21,A24,A5,A8,B10,B101,B105,B107,B108,B109,B111,B113,B117,B118,B119,B121,B122,B125,B128,B129,B132,B133,B138,B14,B140,B16,B25,B29,B31,B34,B45,B52,B55,B59,B62,B7,B70,B71,B81,B82,B84,B86,B91,B94,C1,C10,C11,C12,C13,C17,C19,C27,C29,C32,C34,C35,C38,C44,C47,C50,C51,C55,C58,C6,C61,C68,C69,C72,C79,C80,C9,D2,D4,D9
`Chr7:36870767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr7:36870909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:36870972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B61,C31
`Chr7:36871025`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	104	A13,A18,A22,A3,A5,A7,A9,B10,B104,B105,B106,B109,B110,B113,B114,B115,B117,B118,B120,B129,B134,B135,B137,B140,B15,B16,B18,B21,B36,B38,B39,B40,B42,B44,B47,B48,B49,B56,B58,B60,B61,B64,B65,B66,B67,B69,B70,B71,B74,B76,B77,B78,B8,B82,B85,B9,B93,B95,B96,C12,C15,C17,C18,C19,C20,C23,C24,C25,C26,C32,C38,C4,C40,C41,C43,C45,C47,C52,C55,C58,C59,C60,C62,C68,C71,C72,C73,C74,C78,C81,C82,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D6,D8,D9
`Chr7:36871083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A5,B106,B115,B129,B137,B14,B21,B60,B61,B64,B65,B66,B71,B8,C23,C26,C32,C62,C68,C74,C78,C81,C87,D10,D6
`Chr7:36871153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:36871173`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A3,A9,B104,B105,B114,B120,B134,B135,B15,B18,B35,B38,B39,B44,B48,B70,B78,B82,B85,B9,C12,C17,C18,C24,C25,C4,C55,C65,C71,C84,D11,D2,D3,D8,D9
`Chr7:36871200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B120,B18,B48,C24
`Chr7:36871237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,D7
`Chr7:36871249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:36871266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775198.1

229 aa

114

229

RVT_1

PF00078 RVT_1 13-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775198.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	13	130	7.2e-08	33.3	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919215.1
ATGTGCATTCGTATTATTTCTTATGAAGTCCTTGTCAGCGGGACGACTGTTGGCCCGATTATCCTGGGCAGGGGACTCCGGCAAGGGGATCCCATCTCCCCCTACCTGTTTATACTTTGTGCAGAGGGCCTTTCGGCCATGATCAACCACGAGACAGCAAGAGGCGACCTACACGACATTCAATTTGGTCGGAGGGGACCGGCTATATCTCACCTTATGTTCACTGACGATTGTGTTTTCTTTTGCCGAGCCTCAACAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994182
ATGTGCATTCGTATTATTTCTTATGAAGTCCTTGTCAGCGGGACGACTGTTGGCCCGATTATCCTGGGCAGGGGACTCCGGCAAGGGGATCCCATCTCCCCCTACCTGTTTATACTTTGTGCAGAGGGCCTTTCGGCCATGATCAACCACGAGACAGCAAGAGGCGACCTACACGACATTCAATTTGGTCGGAGGGGACCGGCTATATCTCACCTTATGTTCACTGACGATTGTGTTTTCTTTTGCCGAGCCTCAACAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775198.1
MCIRIISYEVLVSGTTVGPIILGRGLRQGDPISPYLFILCAEGLSAMINHETARGDLHDIQFGRRGPAISHLMFTDDCVFFCRASTTECANLKRVLGVYELALGQAINYQKSGIFFSSNVGDDERTTISTTLGVTMLLNTGRYLGLPSLIGRKKTEIFKYLQDRLWSRIQGWNRKKLSKVGKEVLIKSVAQAIPSYCMTIFLLPMSLTSEMERLMNNFWWGIRGELKNE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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