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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003403`

染色体: Chr07 坐标: 36945569-36950940 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003403`
名称	SmilChr07G003403
描述	inactive leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g60630
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	36945569 - 36950940 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996293`
GeneID	`130996293`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996293`
原始查询	`SmilChr07G003403`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	inactive leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g60630
产物	inactive leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g60630
Arabidopsis	`AT1G10850` (AT1G10850) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766694] identity=61.6; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0681100` - identity=37.8; qcov=0.968; evalue=3.54e-109; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996293

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777783.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777783.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777783.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777783.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777783.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:36946779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:36947144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:36947154`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B10
`Chr7:36947154`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B10
`Chr7:36947487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:36947576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C18
`Chr7:36950185`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A23,B118,B31,B45,C11,C17,C58,C9
`Chr7:36950189`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A23,B118,B31,B45,C11,C17,C58,C9
`Chr7:36950194`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A23,B118,B31,C17,C9
`Chr7:36950194`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A23,B118,B31,C17,C9
`Chr7:36950196`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A23,B118,B31,C17,C9
`Chr7:36950196`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A23,B118,B31,C17,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777783.1

664 aa

332

664

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 38-71 aa PF00560 LRR_1 126-147 aa PF13855 LRR_8 126-185 aa PF00560 LRR_1 151-172 aa PF00069 Pkinase 362-593 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 363-566 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777783.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	38	71	0.00012	23.0	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057777783.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	126	147	7.8e-12	43.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057777783.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	126	185	3.8e-08	33.7	Leucine rich repeat
`XP_057777783.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	151	172	7.8e-12	43.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057777783.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	362	593	3e-36	125.9	Protein kinase domain
`XP_057777783.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	363	566	4.8e-30	105.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921800.1
GAGTGTAGTTTAGCTTTCATGAGTTATTCACTTGCACGTACAAATAGTATTTTATGAAAGTTGAAGGTTTTGAAGAGAGCCACAAAATGGTTGTAAGTATGCCACCTGAATCCGTGTTCCCCACCTAAGATCATTTATTGCCTCCTCTGTTTCTGCTGCCTGCTTTCAATTCCTCCACCATTTACCCATTTATGGTTAATAGAAAGATTACTTGAGTTGCCCCTCTCTCTCTCTCTCATCAACTGTTTCTAGTCTTGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996293
ATGGATGGTGTATTGCCAGTACTGGTGCTTAGGCACAACCCCTTTTGCTCACTCTTCTTGTTCTCACCATTGTTGTTGATGTTCATCACACTGCCACCACTAGTTAGATCAGGCGATGCCGAGGCTCTCTTGGCTCTGAGAGCCTCGATGGACCCGGTGGGGGTGCTCCCGTGGGCACGGGGAGGAGGTGATGTTTGCCAGTGGCAAGGTGTTAAAGAGTGCTTGAATGGGAGGGTGACTAAGCTTGTGGTGGAGAGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777783.1
MDGVLPVLVLRHNPFCSLFLFSPLLLMFITLPPLVRSGDAEALLALRASMDPVGVLPWARGGGDVCQWQGVKECLNGRVTKLVVERFNLNGTLDGKSLNQLDQLRVLSFKENSISGQIPELPGLLNLKSLYLNNNRFSGRIPVSLARMHRLKVVVLSENRISGQIPQAFLSLSRLYVLFVQDNRLSGAIPPFNQTSLRFFNVSNNLLSGRIPITAALAKFDGFSFLANVDLCGEQIQKPCRFGPSTSPSYSVMPGEMGHH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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