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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003416`

染色体: Chr07 坐标: 37232789-37236578 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003416`
名称	SmilChr07G003416
描述	tRNase Z TRZ2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	37232789 - 37236578 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992855`
GeneID	`130992855`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992855`
原始查询	`SmilChr07G003416`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNase Z TRZ2, chloroplastic
产物	tRNase Z TRZ2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G04530` (CPZ) Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814995] identity=70.87; qcov=0.938; evalue=4.54e-180; confidence=high
Rice	`Os09g0482680` - identity=72.85; qcov=0.85; evalue=1.14e-168; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12706 (Lactamase_B_2); PF23023 (Anti-Pycsar_Apyc1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992855

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057773601.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057773601.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:37232967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:37232995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B101,B132,B91,C35
`Chr7:37233660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,C59,C65,C81
`Chr7:37233667`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B100
`Chr7:37233667`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B100
`Chr7:37234288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B52,B86
`Chr7:37234331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B21,C56
`Chr7:37234505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr7:37234509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,D11,D3
`Chr7:37236428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr7:37236454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773601.1

354 aa

177

354

Lactamase_B_2

Anti-Pycsar_Apyc1

PF12706 Lactamase_B_2 117-318 aa PF23023 Anti-Pycsar_Apyc1 117-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773601.1`	Pfam	`PF12706`	Lactamase_B_2	Domain	117	318	1.6e-10	41.6	Beta-lactamase superfamily domain
`XP_057773601.1`	Pfam	`PF23023`	Anti-Pycsar_Apyc1	Family	117	322	7e-10	39.8	Anti-Pycsar protein Apyc1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917618.1
CACACACTCACTGAGACACCTCTTCTTTCCCTCTCAAAACAAAACAACCAAATGATATCACTAAACCCCGCAACCTCAAATCTCCTCAATTTCCATCATTTTCACCAATTTCCACCACCACCAACCCTCAAACATCACCTTCTAATCCAACCTCGAACCGTAAATGCGGCGGTGCAGAGCGGCGCCGGTGGTGGCTCAGGCTTTTTGACAGCAATTGGGCGTGCAATAGAGGAAGAGGAGTACAGAAAGGCCAGGGCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992855
ATGATATCACTAAACCCCGCAACCTCAAATCTCCTCAATTTCCATCATTTTCACCAATTTCCACCACCACCAACCCTCAAACATCACCTTCTAATCCAACCTCGAACCGTAAATGCGGCGGTGCAGAGCGGCGCCGGTGGTGGCTCAGGCTTTTTGACAGCAATTGGGCGTGCAATAGAGGAAGAGGAGTACAGAAAGGCCAGGGCTGAGGTCCACAGAAAAAGCATCGATTTGGACGGTTATTCGATCGAAGGGCTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773601.1
MISLNPATSNLLNFHHFHQFPPPPTLKHHLLIQPRTVNAAVQSGAGGGSGFLTAIGRAIEEEEYRKARAEVHRKSIDLDGYSIEGLSIGGHETCVIVPELKTAFDIGRCPAKAVQQNFLFITHAHLDHIGGLPMYIATRGLYSLKPPTVFVPPSIMEDVEQLINIHRTMGHVELNVDLVALDVGETYEMRNDLVVRPFRTHHVITSQGYVIYSVRKKLRKQYTHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILCPEVAFTGDTTSDFF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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