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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003445`

染色体: Chr07 坐标: 38266254-38271551 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003445`
名称	SmilChr07G003445
描述	uncharacterized SmilChr07G003445
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	38266254 - 38271551 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992890`
GeneID	`130992890`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992890`
原始查询	`SmilChr07G003445`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819161]; symbol=AT2G45530; hit=AT2G45530; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819161]; symbol=AT2G45530; hit=AT2G45530; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G45530` (AT2G45530) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819161] identity=69.1; qcov=0.754; evalue=8.4e-75; confidence=high
Rice	`Os10g0481450` - identity=63.2; qcov=0.75; evalue=4.54e-72; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992890

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057773632.1`
2	Endosome	内体	0.40000	`XP_057773632.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057773632.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057773632.1`
5	Endosome membrane	内体膜	0.20000	`XP_057773632.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:38266631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B115,C87
`Chr7:38266837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:38267045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr7:38271131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,C53
`Chr7:38271162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr7:38271165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr7:38271214`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	D10,D7
`Chr7:38271214`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	D10,D7
`Chr7:38271232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773632.1

232 aa

116

232

RINGv

PF12906 RINGv 74-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773632.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	74	119	1.3e-11	45.1	RING-variant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917649.1
GAAGATTTATACAAGTGCGAAAGAAAATCAAACCAAAATCCACCAAATAAAACCAAAAAACTAAGAACGAAATACGAGTAAAGAAAAGAGCAAACTCCAAGTCTCTCTCTCTCCTTTCTCTTGTGTGATGTAAATTCTACAACAAACTCTCATCTACTCCTCTGATTCTCTTCTGCTTCCTTTACCTTTTCCTCTTCTCCTTTTTGCATTCCTCCCAAATCCGAACTACAAATAAGTTCGATTCTCCAATTTTGATAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992890
ATGCGGAATGGTGGTACTGCAACTATGGTTGGTGAATTTCCCGACGCCGACATCGAGAAGCAGCAGAACGCAGGGGCGGAGGACGGCGGCGGCGTACCGGAAAATGCGGCCGAAGGTCAATCTCAGGACTTGGCTGAGAAAGTAATTGAAGTGGTGGTCGTGGACTGCGCCAACAAAGCTGAATCAGTGCCCGAGAGAGATTCGAATACTCATGAAGAGTGCAGGGTATGCCAGGAGGAAAATGAAGAAGCCTTGATCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773632.1
MRNGGTATMVGEFPDADIEKQQNAGAEDGGGVPENAAEGQSQDLAEKVIEVVVVDCANKAESVPERDSNTHEECRVCQEENEEALISLGCLCRGGLSKAHHSCIVKWFNTRGSNKCEICQQVAANVIPPDPQTSYWVWTVDPAFRAQDRQRGCFSPLWVAFSILVGGLLLDVLISVTLGVSALPVNIIIGVIVVLGLGTALRLGLEFCQEWNVRRVVQRVEANATIGYHPAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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