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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003446`

染色体: Chr07 坐标: 38321444-38323549 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003446`
名称	SmilChr07G003446
描述	uncharacterized protein ycf20
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	38321444 - 38323549 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992895`
GeneID	`130992895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992895`
原始查询	`SmilChr07G003446`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0488600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os04g0488600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G43050` (NPQ6) YCF20-like protein (DUF565) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834320] identity=83; qcov=0.926; evalue=5.31e-65; confidence=high
Rice	`Os04g0488600` - identity=86.4; qcov=0.909; evalue=2.24e-65; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04483 (DUF565)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992895

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057773641.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057773641.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057773642.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057773641.1`
5	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057773642.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:38321652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:38321712`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr7:38321712`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr7:38321729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B86
`Chr7:38321736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:38321784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,C35,C39,C40,C83
`Chr7:38321799`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B128,B16,B22,C5
`Chr7:38321799`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B128,B16,B22,C5
`Chr7:38321805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:38321841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr7:38321912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	81	A1,A10,A11,A18,A21,A22,A3,A7,A9,B101,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B12,B122,B123,B131,B132,B135,B138,B17,B19,B22,B23,B24,B27,B28,B35,B47,B50,B53,B55,B57,B66,B67,B73,B76,B80,B85,B89,B91,B95,B98,B99,C1,C17,C21,C23,C24,C29,C3,C30,C35,C37,C4,C41,C42,C44,C46,C48,C52,C54,C56,C57,C59,C6,C61,C63,C64,C66,C77,C78,C83,C87,C9,D11,D4,D8
`Chr7:38321993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773641.1

155 aa

155

DUF565

PF04483 DUF565 101-155 aa

XP_057773642.1

121 aa

121

DUF565

PF04483 DUF565 67-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773641.1`	Pfam	`PF04483`	DUF565	Family	101	155	6.8e-20	71.9	Protein of unknown function (DUF565)
`XP_057773642.1`	Pfam	`PF04483`	DUF565	Family	67	121	4.4e-20	72.5	Protein of unknown function (DUF565)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917659.1
TAGAATTACAAACCCTAGTTTCTACTTTTCTCCAACTCCCTCGGTCCCTCTAGGTCGCCGCTCTCAGTCTCAGCCCTTCACCCTGCCCATCTCCCTCCCTTTCGTCGCCCCATTCACGACCTCACCCTGCCCATCTCACTCTCAATCCAGTCGCCGGCGAAGGCGAGGATAGGCGGACAGCATATTCCATCCCGCTAGATAGCCGCCCATCTCTCTCTCTTTTACAGCCTCGTAGACGGCCGGCGAAGGGAACTTACAGG...

XM_057917658.1
TAGAATTACAAACCCTAGTTTCTACTTTTCTCCAACTCCCTCGGTCCCTCTAGGTCGCCGCTCTCAGTCTCAGCCCTTCACCCTGCCCATCTCCCTCCCTTTCGTCGCCCCATTCACGACCTCACCCTGCCCATCTCACTCTCAATCCAGTCGCCGGCGAAGGCGAGGATAGGCGGACAGCATATTCCATCCCGCTAGATAGCCGCCCATCTCTCTCTCTTTTACAGCCTCGTAGACGGCCGGCGAAGGGAACTTACAGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992895
ATGTCGATGTCCACCACAGGATGCTCTGAATCTAAGGACAGTGAAGGGCCTCGACGATTAGTTGACATTATACGAATCATACCAGATGTTTCACGCAATTATTTCAGAAGCCCGTCAAGAAGGGCACTCTTTGGCGGCATCTCTCTCTTGGGTGGCTTCTACGTCGCCCAAACCATCTCTCTTTCTTTCGGAGCTTTAGGTGTCAATGACGTTATAGCAGCAGTGCTGTGTGTTCTAATTACGGAGTATGTGACGAGGTT...

LOC130992895
ATGGCAAATGCTGTTGCTTTGAGTTGCACTGGCCTCCTTGAATACGGTGTCATTGCTAAAACAAGCAATTCAAATGTAAAGTGGGGAACTTTTAGTTCAAGATCCTCATCAAGTTCCTTTAGAGTTGGTGCTGTGCAGGACAGTGAAGGGCCTCGACGATTAGTTGACATTATACGAATCATACCAGATGTTTCACGCAATTATTTCAGAAGCCCGTCAAGAAGGGCACTCTTTGGCGGCATCTCTCTCTTGGGTGGCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773641.1
MANAVALSCTGLLEYGVIAKTSNSNVKWGTFSSRSSSSSFRVGAVQDSEGPRRLVDIIRIIPDVSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGALGVNDVIAAVLCVLITEYVTRFYYSRPKITFAVALLNNFKMGFTYGLFIDAFKLAS

XP_057773642.1
MSMSTTGCSESKDSEGPRRLVDIIRIIPDVSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGALGVNDVIAAVLCVLITEYVTRFYYSRPKITFAVALLNNFKMGFTYGLFIDAFKLAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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