当前解析结果
SmilChr07G003449| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003449 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003449 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003449 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 38389580 - 38392982 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994195 |
|---|---|
| GeneID | 130994195 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994195 |
| 原始查询 | SmilChr07G003449 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os07g0525400; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os07g0525400; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT4G28550 (AT4G28550)Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828973] identity=65.8; qcov=0.263; evalue=4.16e-13; confidence=weak |
| Rice | Os07g0525400- identity=50; qcov=0.423; evalue=1.43e-15; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994195 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057775212.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775212.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057775212.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775212.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775212.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:38391828 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:38392356 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B17,B84 |
Chr7:38392392 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B33,B53,C2,C53,C87 |
Chr7:38392491 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B137,B18,B59,B81,B85 |
Chr7:38392491 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B137,B18,B59,B81,B85 |
Chr7:38392498 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,B76 |
Chr7:38392501 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr7:38392515 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C55 |
Chr7:38392516 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,B72 |
Chr7:38392519 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B17,C40,C52 |
Chr7:38392521 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B43,B52,B77,C54 |
Chr7:38392529 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C13 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。