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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003464`

染色体: Chr07 坐标: 38716879-38717739 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003464`
名称	SmilChr07G003464
描述	uncharacterized SmilChr07G003464
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	38716879 - 38717739 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994201`
GeneID	`130994201`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994201`
原始查询	`SmilChr07G003464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=29.4; qcov=0.594; evalue=1.19e-20; confidence=low
Rice	`Os09g0268800` - identity=21.7; qcov=0.661; evalue=3.21e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994201

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775217.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057775217.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057775217.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775217.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775217.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:38716930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr7:38716930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:38716935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,C33,C72,D7
`Chr7:38716983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B64,C58,D7
`Chr7:38717000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr7:38717002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B126,C48,C58
`Chr7:38717015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr7:38717037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C8
`Chr7:38717044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B50,C12
`Chr7:38717056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C8
`Chr7:38717074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr7:38717105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B102,B108,C38,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775217.1

286 aa

143

286

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 21-105 aa PF14392 zf-CCHC_4 164-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775217.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	21	105	1.3e-09	38.3	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057775217.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	164	210	1.6e-06	28.3	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919234.1
ATGAAGAATAATCAACTAAGTTTTGACATACCTGATGAGCTTTACAAGCAACAACTGCAACACTTTAAGTTTGCCTTGCATGGCCGTCTTTTATTACAAAAAGGCGATTCGCCCAGATTTGCAGAGGACATCAAAAGGGAATTACAGGAGACGTGGAAGATCTCGGCGCCTTGGCAAGTCATACTTCTTGGAAAGGGATTCTTCACGCTTCGTTTTTCTGGTGAATCCGACATGATGCAAGCGAAATCCAAAGCTTTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994201
ATGAAGAATAATCAACTAAGTTTTGACATACCTGATGAGCTTTACAAGCAACAACTGCAACACTTTAAGTTTGCCTTGCATGGCCGTCTTTTATTACAAAAAGGCGATTCGCCCAGATTTGCAGAGGACATCAAAAGGGAATTACAGGAGACGTGGAAGATCTCGGCGCCTTGGCAAGTCATACTTCTTGGAAAGGGATTCTTCACGCTTCGTTTTTCTGGTGAATCCGACATGATGCAAGCGAAATCCAAAGCTTTCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775217.1
MKNNQLSFDIPDELYKQQLQHFKFALHGRLLLQKGDSPRFAEDIKRELQETWKISAPWQVILLGKGFFTLRFSGESDMMQAKSKAFWKLKTGIMKIREWTPLFNPYKETSTLAQVWMRIYYLPHELWHPEVVTGISRVVGNPIKMDGTTFQGAVGHFARVLVEMDVTKDILYNLNITRGSASFDIEFVYENLPFYCGICRKIGHSSDKCRRKTEDVLKEDQGNKPEKQKIDTATNDPGGLMKKKPDQNKDWKKVNTRKID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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