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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003482`

染色体: Chr07 坐标: 39180193-39185047 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003482`
名称	SmilChr07G003482
描述	beta-carotene isomerase D27, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	39180193 - 39185047 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992886`
GeneID	`130992886`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992886`
原始查询	`SmilChr07G003482`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-carotene isomerase D27, chloroplastic
产物	beta-carotene isomerase D27%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G64680` (AT1G64680) beta-carotene isomerase D27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842776] identity=75; qcov=0.923; evalue=3.84e-135; confidence=high
Rice	`Os08g0114100` - identity=71.1; qcov=0.946; evalue=1.28e-119; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF13225 (D27-like_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992886

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057773628.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057773628.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057773629.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773628.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773628.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:39181391`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A13,A23,A4,B107,B12,B120,B124,B126,B20,B35,B37,B40,B48,C11,C13,C16,C33,C36,C5,C62,C67,C69,C75,C77,D5
`Chr7:39181423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr7:39181449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr7:39181473`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	36	A10,A19,A21,A23,A25,A6,B100,B11,B125,B135,B136,B140,B17,B21,B26,B32,B34,B41,B64,B72,B73,B86,B89,B90,C25,C28,C49,C55,C60,C62,C7,C75,C76,C79,C81,D11
`Chr7:39181958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:39183914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr7:39184622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:39184637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:39184745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:39184825`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C54
`Chr7:39184825`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C54
`Chr7:39184870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773628.1

288 aa

144

288

D27-like_C

PF13225 D27-like_C 150-231 aa

XP_057773629.1

260 aa

130

260

D27-like_C

PF13225 D27-like_C 150-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773628.1`	Pfam	`PF13225`	D27-like_C	Domain	150	231	1.9e-38	131.0	Beta-carotene isomerase D27-like, C-terminal
`XP_057773629.1`	Pfam	`PF13225`	D27-like_C	Domain	150	231	1.7e-38	131.2	Beta-carotene isomerase D27-like, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917646.1
ATAGTATAAGGTTGTCAGTCCGTGACGGGGCACATGTATGGCCACCATTCTTCCGATAAGAGTAGGGAACCCAAAACACCACCACACGCCACACGCCACACGCCCATATAATTCCTTTTTCCTTTTTTTATTTCTAATTTGTGAATCTAATACCAAAAAGTGGAATTAATGGCGGTTCTAAGTTTGGCAGCAAGTAAGTCACTGTTCCCGTCATCATGTTGGTCTGAGAGTCGCAGGAATTTGCATTCGCGCGGCGGCGT...

XM_057917645.1
ATAGTATAAGGTTGTCAGTCCGTGACGGGGCACATGTATGGCCACCATTCTTCCGATAAGAGTAGGGAACCCAAAACACCACCACACGCCACACGCCACACGCCCATATAATTCCTTTTTCCTTTTTTTATTTCTAATTTGTGAATCTAATACCAAAAAGTGGAATTAATGGCGGTTCTAAGTTTGGCAGCAAGTAAGTCACTGTTCCCGTCATCATGTTGGTCTGAGAGTCGCAGGAATTTGCATTCGCGCGGCGGCGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992886
ATGGCGGTTCTAAGTTTGGCAGCAAGTAAGTCACTGTTCCCGTCATCATGTTGGTCTGAGAGTCGCAGGAATTTGCATTCGCGCGGCGGCGTAGTGCGGTGTGGGATAGCGGAGGCGTCGGGGCAGCCGGCGCCGATGGGGCAGAAGACCAAGTACAAGGACGGGGTGTTTGAGAGGGTGTTCATGAGCCTCTTCTCGCGGAAGATGGAGAAATTCGGGCGCGGCCGAGAACCGGAGAAGGGGCTCTTCGACTGCGACTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773628.1
MAVLSLAASKSLFPSSCWSESRRNLHSRGGVVRCGIAEASGQPAPMGQKTKYKDGVFERVFMSLFSRKMEKFGRGREPEKGLFDCDYDSFVEVSRSVMEGRTRLQQQQVVREVLLSMLPPGAPAQFRKLFPPTRWAAEFNAALTVPFFHWLVGPSEVVEVEVNGVKQKSGVLIKKCRYLENSGCVGMCVNMCKIPTQDFFTNEFGLPLTMNPNFEDMSCEMIYGQVPPRFEDDPVSKQPCLPKFCKFFSLYLGFYIYIYI...

XP_057773629.1
MAVLSLAASKSLFPSSCWSESRRNLHSRGGVVRCGIAEASGQPAPMGQKTKYKDGVFERVFMSLFSRKMEKFGRGREPEKGLFDCDYDSFVEVSRSVMEGRTRLQQQQVVREVLLSMLPPGAPAQFRKLFPPTRWAAEFNAALTVPFFHWLVGPSEVVEVEVNGVKQKSGVLIKKCRYLENSGCVGMCVNMCKIPTQDFFTNEFGLPLTMNPNFEDMSCEMIYGQVPPRFEDDPVSKQPCLPKFCSIANPNSSLCPKLKA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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