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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003494`

染色体: Chr07 坐标: 39604527-39608712 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003494`
名称	SmilChr07G003494
描述	probable lysophospholipase BODYGUARD 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	39604527 - 39608712 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992877`
GeneID	`130992877`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992877`
原始查询	`SmilChr07G003494`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable lysophospholipase BODYGUARD 1
产物	probable lysophospholipase BODYGUARD 1
Arabidopsis	`AT4G24140` (AT4G24140) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828514] identity=58; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0532200` - identity=60.1; qcov=0.918; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF06821 (Ser_hydrolase); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992877

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057773619.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057773619.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057773619.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773619.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773619.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:39605259`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A18,A19,B11,B114,B125,B129,B17,B26,B32,B5,B72,B73,B89,B90,B92,C21,C30,C40,C49,C50,C55,C60,C72,C77,C85,D10
`Chr7:39605261`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A18,A19,B11,B114,B125,B129,B17,B26,B32,B5,B72,B73,B89,B90,B92,C21,C30,C40,C49,C50,C55,C72,C77,D10
`Chr7:39606572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr7:39606902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B114,B17,B73,C30
`Chr7:39608050`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B73
`Chr7:39608050`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B73
`Chr7:39608052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:39608059`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B73
`Chr7:39608059`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B73
`Chr7:39608126`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	106	A1,A10,A13,A15,A16,A2,A20,A3,B10,B101,B102,B107,B109,B113,B114,B12,B120,B123,B124,B125,B128,B130,B131,B136,B137,B139,B14,B140,B15,B2,B24,B27,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B38,B39,B41,B43,B44,B5,B50,B52,B55,B56,B57,B58,B61,B62,B66,B68,B7,B77,B78,B82,B86,B90,B91,B92,B94,B96,B99,C1,C13,C14,C15,C16,C17,C2,C20,C24,C27,C28,C29,C33,C4,C41,C42,C44,C47,C48,C5,C51,C52,C58,C60,C61,C63,C71,C76,C77,C8,C80,C82,C83,C85,C86,D1,D10,D11,D2,D7
`Chr7:39608168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr7:39608169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773619.1

502 aa

251

502

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

Ser_hydrolase

PF12146 Hydrolase_4 220-473 aa PF00561 Abhydrolase_1 225-333 aa PF12697 Abhydrolase_6 225-491 aa PF06821 Ser_hydrolase 295-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773619.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	220	473	3.5e-13	50.2	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057773619.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	225	333	1.3e-29	104.3	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057773619.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	225	491	7.8e-18	66.6	Alpha/beta hydrolase family
`XP_057773619.1`	Pfam	`PF06821`	Ser_hydrolase	Domain	295	338	5.7e-05	23.8	Serine hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917636.1
ATAAAAGACAGATACACACATGTAGTTTATTGCATAGAGGTTAGATTCTTTGAGAAAAACTTGTATCTCTCTTTGCAGGAGGTTCAACCACCACCAACTTTTTTTCGCTTGCTGATTTTAATGAATTCATTTTATCTGCAACCTATGTTTCGTGTCAGAGAAACCCCCTTATTCTTCACCCTGTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTAACAATTGCATTTGTGGCCTATAATTCAGTACCCCTTTCGCTCTTCTGCTTTCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992877
ATGCTCCTCGCATTCTTGCACGCAAATACCCCAGAAACGAGCTTCTCTAATCATGGCATTTTTCTCACTTTGATTTCTCCAAATTCTCGATTTTTTCTTTATTTTCCGAGGAAGATGATAATGGCGGTGAAATCTACCGCGAGAATGGGAGGGAGATTGTTGAATGAAATCTTGAGTTTCTTAGTGTTCAGTGTGTTGGACGTGGTGGATATGATTCTGTGCTACGTTTACAAAGTGGCGGATTTCTTCATCGAGGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773619.1
MLLAFLHANTPETSFSNHGIFLTLISPNSRFFLYFPRKMIMAVKSTARMGGRLLNEILSFLVFSVLDVVDMILCYVYKVADFFIEAEWKACYCSSSSSSSAVAGGGKIVVSEAGESKIVRLTCSKLHLEEISDTLYTRPSLVSAVSKSTVIRPSRRXPAVRSSFTVNSTVINMLQGRIGRLQTLPIPRWSDCNCKTCTSWTAASCRDTLFVKVDGAPGGNAREDVVFIHGFISSSAFWTETLYPNFSKSAKSKYRLFAVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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