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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003509`

染色体: Chr07 坐标: 40001321-40002764 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003509`
名称	SmilChr07G003509
描述	uncharacterized SmilChr07G003509
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	40001321 - 40002764 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994215`
GeneID	`130994215`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994215`
原始查询	`SmilChr07G003509`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=34.6; qcov=0.471; evalue=3.39e-41; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994215

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775233.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057775233.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775233.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775233.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775233.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:40001341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B87
`Chr7:40001341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr7:40001350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B124,B72
`Chr7:40001434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B136,B35,B84
`Chr7:40001462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr7:40001465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,B80,B84
`Chr7:40001467`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	140	A1,A10,A14,A18,A2,A20,A24,A25,A3,A5,A7,B100,B103,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B115,B117,B119,B120,B123,B127,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B139,B14,B140,B15,B18,B20,B23,B24,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B4,B40,B41,B45,B46,B47,B48,B50,B51,B53,B55,B56,B58,B6,B60,B62,B64,B67,B68,B69,B7,B72,B73,B78,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B95,B97,B98,C1,C10,C12,C14,C15,C16,C18,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C32,C35,C36,C40,C41,C42,C43,C45,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C67,C69,C7,C71,C72,C76,C79,C8,C80,C87,C9,D11,D2,D6,D7
`Chr7:40001470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A21,A4,A9,B102,B110,B119,B123,B127,B129,B130,B134,B136,B16,B31,B33,B40,B63,B7,B77,B78,B82,B86,B87,B93,C17,C23,C3,C32,C33,C35,C58,C68,D4
`Chr7:40001477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr7:40001481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,B75,B80,B84,C82
`Chr7:40001500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,C10,C56,C74
`Chr7:40001518`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	B120,B14,B31,B53,B55,B70,B79,B85,C23,C27,C33,C39,C47,C52,C53,C74,C78,C81,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775233.1

454 aa

227

454

DUF7769

PF24964 DUF7769 8-62 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775233.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	8	62	1.8e-10	41.0	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919250.1
ATGGCCATAGAAAGGCCAAAACTAAAAGATGATGAAAGAAATAAAGTTGCTCAGTGGCTGTTAGAACATAGCAGTGCAGGGAAATTGCAGCATGGAGCCAAAAAGGAGGCGGCACTTCACTTCAAAGTGAACTTGAAGACCATTTGGAAGATTTGGAGCCAAGTCTCCCATCAAAGAGCATGTGGTGTACCTGTCGAGGTAAAATCAATTAGAAAAGGCTGTCTACACAAGGATAAGAAACACATTGATGTTGAAAAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994215
ATGGCCATAGAAAGGCCAAAACTAAAAGATGATGAAAGAAATAAAGTTGCTCAGTGGCTGTTAGAACATAGCAGTGCAGGGAAATTGCAGCATGGAGCCAAAAAGGAGGCGGCACTTCACTTCAAAGTGAACTTGAAGACCATTTGGAAGATTTGGAGCCAAGTCTCCCATCAAAGAGCATGTGGTGTACCTGTCGAGGTAAAATCAATTAGAAAAGGCTGTCTACACAAGGATAAGAAACACATTGATGTTGAAAAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775233.1
MAIERPKLKDDERNKVAQWLLEHSSAGKLQHGAKKEAALHFKVNLKTIWKIWSQVSHQRACGVPVEVKSIRKGCLHKDKKHIDVEKVKKLSVLERSSLRCMSTHLGVSKSLIHKWVKERKLKPHTNAIKPFLTPQNRLCRLSWSLKQLSSLSEDGFIQFQSMYNTIHIDEKWFYLTKTKDRYYLMPDEVEPYRTCKSKRYIEKIMFMCAVARPIIDEDGTIIFDGKLGIFPFTTTEPAQRNSKNRSKGTMEVKPIAAVTK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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