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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003535`

染色体: Chr07 坐标: 40799001-40803258 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003535`
名称	SmilChr07G003535
描述	transcription factor EMB1444-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	40799001 - 40803258 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992954`
GeneID	`130992954`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992954`
原始查询	`SmilChr07G003535`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor EMB1444-like
产物	transcription factor EMB1444-like
Arabidopsis	`AT2G27230` (LHW) transcription factor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817265] identity=47.1; qcov=0.303; evalue=1.24e-53; confidence=low
Rice	`Os02g0673500` - identity=53.1; qcov=0.32; evalue=2.03e-63; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF14215 (bHLH-MYC_N); PF23176 (bHLH_LHW)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992954

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773659.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773659.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773659.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773659.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773659.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:40799541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:40799696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:40800481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr7:40800603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr7:40800767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,C25,C38,C50
`Chr7:40800945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:40801145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:40801585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773659.1

694 aa

347

694

bHLH-MYC_N

bHLH_LHW

PF14215 bHLH-MYC_N 3-40 aa PF14215 bHLH-MYC_N 50-144 aa PF23176 bHLH_LHW 487-546 aa

XP_057773661.1

693 aa

346

693

bHLH-MYC_N

bHLH_LHW

PF14215 bHLH-MYC_N 3-40 aa PF14215 bHLH-MYC_N 50-143 aa PF23176 bHLH_LHW 486-545 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773659.1`	Pfam	`PF14215`	bHLH-MYC_N	Family	3	40	2.2e-24	87.5	bHLH-MYC and R2R3-MYB transcription factors N-terminal
`XP_057773659.1`	Pfam	`PF14215`	bHLH-MYC_N	Family	50	144	2.2e-24	87.5	bHLH-MYC and R2R3-MYB transcription factors N-terminal
`XP_057773659.1`	Pfam	`PF23176`	bHLH_LHW	Domain	487	546	3e-24	85.5	Transcription factor LHW bHLH domain
`XP_057773661.1`	Pfam	`PF14215`	bHLH-MYC_N	Family	3	40	1.9e-24	87.6	bHLH-MYC and R2R3-MYB transcription factors N-terminal
`XP_057773661.1`	Pfam	`PF14215`	bHLH-MYC_N	Family	50	143	1.9e-24	87.6	bHLH-MYC and R2R3-MYB transcription factors N-terminal
`XP_057773661.1`	Pfam	`PF23176`	bHLH_LHW	Domain	486	545	3e-24	85.5	Transcription factor LHW bHLH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917676.1
CACAGTTTTTCCAAAGTCTGCATTTCCTGTTTTTATGTTTTTCATTATGATGGCCTCTTTTTAAGCTTTTGGACATTTGGTTCAGAGCTTCAGAGACAGACATCCAACCTTCATCCCTTCCTACTACTATTCCACTTGCTGTTTCTCTACTCTTCAAAAACCAACCACTTTCACTCACAACCATTCATTCTTCCTCCAAAACTCAGTGTGAGTTTACTTTTTCTACCCTAATCTGAACCCAGCCAAAAACACTTTCGCTT...

XM_057917678.1
AAGTCTGCATTTCCTGTTTTTATGTTTTTCATTATGATGGCCTCTTTTTAAGCTTTTGGACATTTGGTTCAGAGCTTCAGAGACAGACATCCAACCTTCATCCCTTCCTACTACTATTCCACTTGCTGTTTCTCTACTCTTCAAAAACCAACCACTTTCACTCACAACCATTCATTCTTCCTCCAAAACTCAGTGTGAGTTTACTTTTTCTACCCTAATCTGAACCCAGCCAAAAACACTTTCGCTTCCACCAAAATCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992954
ATGATGAACGAAACCCTCAAGAATCTTTGCTCTACTAATGGATGGTGTTATGCAGTTTTCTGGGGTTTTGATCACACAAATTCATTACTATTGACATTGAAAGATTGCTACTATGAAGAACAAATGGGAGCGCTGATTGAATCTATGCTTCTGCAAGCACATGTAGTTGGAGGAGGGGTAATTGGGCAAACTGCCTTTGCAAACAAACCTATATGGTTGGATTCAGATGCTCTTCATGAAAGGAGAAATTGTGCAGTATC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773659.1
MMNETLKNLCSTNGWCYAVFWGFDHTNSLLLTLKDCYYEEQMGALIESMLLQAHVVGGGVIGQTAFANKPIWLDSDALHERRNCAVSFDGLDIFQKDSEFFYQFSMGIKTIAVIPVEPWGVVELGSTHKKPEMHDFVDQVQQVFREIDVIEGVGNGSHSDSHLFNSSMQLDSSLSSGIFRSENLIGADQSLVLPCQPFPCTSNQLEHLLLESPNFLDCSAYADDFSLLTSSWPHLDNTSLSEPRDEESCKDSSSNAPLVL...

XP_057773661.1
MMNETLKNLCSTNGWCYAVFWGFDHTNSLLLTLKDCYYEEQMGALIESMLLQAHVVGGGVIGQTAFANKPIWLDSDALHERRNCAVSFDGLDIFQDSEFFYQFSMGIKTIAVIPVEPWGVVELGSTHKKPEMHDFVDQVQQVFREIDVIEGVGNGSHSDSHLFNSSMQLDSSLSSGIFRSENLIGADQSLVLPCQPFPCTSNQLEHLLLESPNFLDCSAYADDFSLLTSSWPHLDNTSLSEPRDEESCKDSSSNAPLVLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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