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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003554`

染色体: Chr07 坐标: 41359189-41362787 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003554`
名称	SmilChr07G003554
描述	2-deoxy-glucose resistant protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	41359189 - 41362787 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992966`
GeneID	`130992966`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992966`
原始查询	`SmilChr07G003554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-deoxy-glucose resistant protein 2-like
产物	2-deoxy-glucose resistant protein 2-like
Arabidopsis	`AT5G24320` (AT5G24320) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832502] identity=43.4; qcov=0.967; evalue=1.02e-169; confidence=medium
Rice	`Os03g0115400` (OsWD40-60) - identity=40.2; qcov=1.01; evalue=3.42e-165; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992966

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057773664.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057773664.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057773664.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773664.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773664.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:41360211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:41360256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C60
`Chr7:41360470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr7:41360521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B65,D6
`Chr7:41360522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B14,C25
`Chr7:41360754`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B27
`Chr7:41360754`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B27
`Chr7:41360849`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C59
`Chr7:41360849`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C59
`Chr7:41360852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr7:41360896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B94,C80
`Chr7:41360916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773664.1

720 aa

360

720

WD40

PF00400 WD40 262-295 aa PF00400 WD40 362-397 aa PF00400 WD40 403-439 aa PF00400 WD40 553-574 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773664.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	262	295	2.9e-37	126.2	WD domain, G-beta repeat
`XP_057773664.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	362	397	2.9e-37	126.2	WD domain, G-beta repeat
`XP_057773664.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	403	439	2.9e-37	126.2	WD domain, G-beta repeat
`XP_057773664.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	553	574	2.9e-37	126.2	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917681.1
TATTAGTATAAAAAAAATAATAAAATAGTAAAATTTAAAAATGGTGCGTAGTTTGTATGTGTAGGTGGGAAAAAAATGGGAAAATTCGAAAGGGAAAAAGGCGAAAAGACTGTCACAGAGCGACACCATTGCCATCTTTTCCACCTTACGACGTTTCCGTTTTCCTCCAAGTCCCGTTTCGGAGGGTTGGAATCTCTTCGTTCTAATCCCACTATATTTTCCGTTATGTATTTATTTTGTGTTGGATTATCCGCCGATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992966
ATGAGCGGAGGCGGAGAAGAAGATCAATTCTTTGAAACGCGTGATGACAACGCCTCTTCTGCATCTGATTTGGGTTCCGATTGTTCAGAATTGTATGTGAATTCTGGGCTTGACAATTGTGCTTTGGAGTATGACTTTTGGACTAAAGAGCCAGGTAGTGTAAATGAGAGACGTGAACGGTTTCTGAGATGGATGGGTTTGAGCCCAGATTGCCGTGGGATTGGTGATGCTGAAGACGAAGATTCGTATCATGATGATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773664.1
MSGGGEEDQFFETRDDNASSASDLGSDCSELYVNSGLDNCALEYDFWTKEPGSVNERRERFLRWMGLSPDCRGIGDAEDEDSYHDDVKRNIDRLSDDGASVLANLDADKQFFSSRSLQSLQSHETTHLLQNGGAEGNLSLMKNDDNGTESVMDELTDEEYLSTSLDFGADKMISLDEFHKTLGSSSLVQQLLMKKCKKLNMVDRSKKSNWLQKFNSVIQIVDRAKGLLSKAEMTMGESTTRRVRVSSCKKNSKELSSLYT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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